JMP Clinical 数据映射工具是 JMP Clinical 18 的一个插件,它允许您将各种文件类型(包括 .sas7bdat、.xls/.xlsx、.csv、.txt 或 .jmp 文件)中的列名映射到 SDTM 中的变量名,这些文件可能不符合 CDISC 标准,并将映射结果保存为 JMP Clinical 使用的不同数据集所需的正确文件名和文件扩展名 (.jmp)。本视频概述了该工具的组成部分。
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文字稿:
本视频概述了 JMP Clinical 18 中的数据映射工具。该映射工具能够将各种文件类型的列名映射到 SDTM 中的变量名,从而准备可能不符合 CDISC 标准的数据,并将映射后的文件保存为 JMP Clinical 可以使用的格式。您可以将设置保存为模板,以便在每次获取新数据时自动打开并运行。
数据映射工具位于“加载项”菜单中。访问此菜单最简单的方法是从 JMP Clinical 主窗口中单击 JMP 图标。
我将从“插件”菜单中选择 JMP 临床数据映射工具,然后就可以关闭此窗口了。该工具包含四个组件:报告要求、研究输入数据、研究输出数据以及添加、刷新或更新研究。我们将在本视频中简要介绍每个组件。
点击展开图标,即可展开“报告要求”部分。默认情况下,此部分处于折叠状态,因为通常情况下您不会在此处进行任何更改。但如果您想查看工具考虑的域和变量,以及在它们不存在时尝试创建的域和变量,则可以展开摘要部分。
第二部分用于指定输入数据的位置。最简单的情况下,您可以直接使用输入数据文件夹。但如果您的数据与最终形式相差甚远——换句话说,如果在使用 JMP Clinical 之前需要进行大量转换——您可以选择指定或录制一个工作流程来创建输入文件夹文件。
在“研究输出数据”部分,您可以指定映射工具是仅创建不存在的必需变量,还是创建其他可选变量。如果选择此项,您可以单击“添加”按钮来选择工具将考虑创建的变量。
您可以指定输出文件夹,工具会将映射过程生成的文件写入该文件夹。每个域都有一个预览部分,其中会显示将要创建的变量;还有一个部分允许您指定新输出列的数据源(来自输入数据)。
在第四部分,您可以设置工具自动添加、刷新或更新研究,并将此工具的输出文件夹作为该研究的输入文件夹。您可以输入新的研究名称,也可以选择现有研究的名称。点击“添加”、“刷新”或“更新研究”按钮即可启动相应的研究管理操作。
最后,当您完成所有设置并测试确保其运行正常后,您可以保存一个模板,该模板会保留这些设置,以便将来在映射工具中打开,从而节省时间。此外,您还可以在模板中指定加载时要执行的任务。例如,您可能希望模板自动运行一个输入工作流并在该工作流结束后停止。
有关 JMP Clinical 数据映射工具的不同组件的更多详细信息,请参阅此页面上链接的文档。