L'outil de mappage des données JMP Clinical est un module complémentaire installé avec JMP Clinical 18. Il permet de faire correspondre les noms de colonnes de différents types de fichiers (.sas7bdat, .xls/.xlsx, .csv, .txt ou .jmp, potentiellement non conformes à la norme CDISC) aux noms de variables SDTM et de les enregistrer avec les noms et extensions de fichiers appropriés (.jmp) pour les différents jeux de données utilisés par JMP Clinical. Cette vidéo présente les composants de l'outil.
Cliquez ici pour accéder à la documentation du module complémentaire JMP Clinical Data Mapping Tool.
Transcription:
Cette vidéo présente l'outil de mappage de données de JMP Clinical 18. Cet outil permet de préparer des données potentiellement non conformes à la norme CDISC en faisant correspondre les noms de colonnes de différents types de fichiers aux noms de variables SDTM, puis en enregistrant les fichiers pour qu'ils soient utilisables par JMP Clinical. Vous pouvez enregistrer vos paramètres comme modèle pour une ouverture et une exécution automatiques à chaque nouvelle version des données.
L'outil de mappage des données est disponible dans le menu Modules complémentaires. Le moyen le plus simple d'accéder à ce menu est de cliquer sur l'icône JMP dans la fenêtre principale de JMP Clinical .
Je vais sélectionner l'outil de mappage des données cliniques JMP dans le menu Modules complémentaires, puis je pourrai fermer cette fenêtre. Cet outil comporte quatre éléments : Exigences du rapport, Données d'entrée de l'étude, Données de sortie de l'étude et Ajout, actualisation ou mise à jour de l'étude. Nous examinerons brièvement chaque élément dans cette vidéo.
Je vais développer la section « Exigences du rapport » en cliquant sur l'icône de développement. Cette section est réduite par défaut, car vous n'y modifierez généralement rien. Toutefois, si vous souhaitez consulter les domaines et les variables que l'outil prend en compte, et qu'il tente de créer s'ils n'existent pas, vous pouvez développer la section « Résumé ».
La deuxième section vous permet de spécifier l'emplacement de vos données d'entrée. Dans le cas le plus simple, vous travaillerez directement avec un dossier de données. Toutefois, si vos données ne sont pas encore finalisées (autrement dit, si de nombreuses transformations sont nécessaires avant leur utilisation dans JMP Clinical), vous pouvez définir ou enregistrer un flux de travail qui créera les fichiers du dossier d'entrée.
La section « Données de sortie de l'étude » vous permet de spécifier si l'outil de mappage doit créer uniquement les variables obligatoires manquantes, ou s'il doit également créer des variables facultatives supplémentaires. Dans ce cas, cliquez sur le bouton « Ajouter » pour sélectionner les variables que l'outil prendra en compte pour la création.
Vous pouvez spécifier le dossier de sortie, où l'outil enregistrera les fichiers résultant du mappage. Une section d'aperçu est disponible pour chaque domaine, indiquant les variables qui seront créées, ainsi qu'une section permettant de spécifier les sources de données d'entrée pour les nouvelles colonnes de sortie.
Dans la quatrième section, vous pouvez configurer l'outil pour qu'il ajoute, actualise ou mette à jour automatiquement une étude en utilisant le dossier de sortie de cet outil comme dossier d'entrée. Vous pouvez saisir un nouveau nom d'étude ou sélectionner celui d'une étude existante. Cliquer sur le bouton « Ajouter », « Actualiser » ou « Mettre à jour l'étude » lance l'opération de gestion d'étude correspondante.
Enfin, une fois tous les paramètres configurés et testés pour vérifier leur bon fonctionnement, vous pouvez enregistrer un modèle qui conserve ces paramètres et pourra être ouvert ultérieurement dans l'outil de mappage, ce qui vous fera gagner du temps. De plus, vous pouvez spécifier, dans ce modèle, les tâches qui s'exécutent lors de son chargement. Par exemple, vous pouvez configurer le modèle pour qu'il exécute automatiquement un flux de travail de saisie et s'arrête à cette étape.
Pour plus de détails sur les différents composants de l'outil de mappage des données dans JMP Clinical, veuillez consulter la documentation disponible sur cette page.
