JMP Clinical Data Mapping Toolは、JMP Clinical 18に付属するアドインで、CDISCに準拠していない可能性のある.sas7bdat、.xls/.xlsx、.csv、.txt、.jmpファイルなど、さまざまなファイル形式の列名をSDTMの変数名にマッピングし、JMP Clinicalで使用されるさまざまなデータセットに適したファイル名とファイル拡張子(.jmp)で保存できます。このビデオでは、ツールの構成要素の概要を説明します。
JMP臨床データマッピングツールアドインのドキュメントはこちらをクリックしてください。
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このビデオでは、JMP Clinical 18 のデータマッピングツールの概要を説明します。マッピングツールを使用すると、さまざまなファイルタイプの列名を SDTM の変数名にマッピングし、JMP Clinical で使用できるようにファイルを保存することで、CDISC に準拠していない可能性のあるデータを準備できます。設定をテンプレートとして保存すれば、新しいデータを取得するたびに自動的に開いて実行できます。
データマッピングツールは、アドインメニューから利用できます。このメニューにアクセスする最も簡単な方法は、JMP ClinicalメインウィンドウのJMPアイコンをクリックすることです。
アドインメニューからJMP臨床データマッピングツールを選択したら、このウィンドウを閉じます。このツールは、レポート要件、研究入力データ、研究出力データ、研究の追加、更新、または更新の4つのコンポーネントで構成されています。このビデオでは、それぞれのコンポーネントについて簡単に説明します。
開示アイコンをクリックして、「レポート要件」セクションを展開します。このセクションは通常、何も変更しないため、デフォルトでは折りたたまれています。ただし、ツールが考慮するドメインと変数、および存在しない場合に作成を試みるドメインと変数を確認したい場合は、概要セクションを展開できます。
2番目のセクションでは、入力データの場所を指定します。最も簡単なケースでは、入力フォルダー内のデータを直接使用します。しかし、データが最終形式に比較的近い状態でない場合、つまり、JMP Clinicalで使用する前に多くの変換処理が必要な場合は、入力フォルダーファイルを作成するワークフローを指定または記録することができます。
「研究出力データ」セクションでは、マッピングツールに存在しない必須変数のみを作成させるか、追加のオプション変数を作成するかを指定できます。このオプションを選択した場合は、「追加」ボタンをクリックして、ツールが作成対象とする変数を選択できます。
出力フォルダを指定できます。このフォルダには、マッピング処理の結果として生成されるファイルが書き込まれます。各ドメインごとにプレビューセクションがあり、作成される変数を確認できます。また、入力データから新しい出力列のデータソースを指定できるセクションもあります。
第4セクションでは、このツールの出力フォルダを入力フォルダとして、研究を自動的に追加、更新、または更新することができます。新しい研究名を入力するか、既存の研究名を選択できます。「研究の追加」、「更新」、「研究の更新」ボタンをクリックすると、それぞれの研究管理操作が開始されます。
最後に、すべての設定が完了し、正しく動作していることを確認するためのテストが完了したら、これらの設定を保持するテンプレートを保存できます。このテンプレートは、今後マッピングツールで開くことができ、時間の節約になります。また、テンプレートの一部として、読み込み時に実行されるタスクを指定することもできます。たとえば、テンプレートが自動的に入力ワークフローを実行し、そこで停止するように設定できます。
JMP Clinicalのデータマッピングツールの各コンポーネントの詳細については、このページにリンクされているドキュメントを参照してください。