L'outil de mappage des données cliniques JMP est un complément installé avec JMP Clinical 18 qui vous permet de mapper les noms de colonnes dans différents types de fichiers, notamment les fichiers .sas7bdat, .xls/.xlsx, .csv, .txt ou .jmp, qui peuvent ne pas être conformes au CDISC pour les noms de variables de SDTM et les enregistrer avec des noms de fichiers et des extensions de fichier (.jmp) appropriés pour les différents ensembles de données utilisés par JMP Clinical. Cette vidéo donne un aperçu des composants de l'outil.
Cliquez ici pour consulter la documentation du complément JMP Clinical Data Mapping Tool.
Transcription:
Cette vidéo donne un aperçu de l'outil de mappage de données dans JMP Clinical 18. L'outil de mappage vous permet de préparer des données susceptibles de ne pas être conformes au CDISC en mappant les noms de colonnes de différents types de fichiers avec les noms de variables de SDTM et en enregistrant les fichiers afin qu'ils peut être utilisé par JMP Clinical. Vous pouvez enregistrer vos paramètres en tant que modèle pour l'ouvrir et l'exécuter automatiquement chaque fois que vous obtenez une nouvelle coupe de données.
L'outil de mappage de données est disponible dans le menu Compléments. Le moyen le plus simple d'accéder à ce menu consiste à cliquer sur l'icône JMP dans la fenêtre principale de JMP Clinical .
Je vais sélectionner l'outil de mappage des données cliniques JMP dans le menu Compléments, puis je pourrai fermer cette fenêtre. L'outil comporte quatre composants : exigences du rapport, données d'entrée de l'étude, données de sortie de l'étude et ajout, actualisation ou mise à jour de l'étude. Nous examinerons brièvement chaque composant dans cette vidéo.
Je vais développer la section Exigence de rapport en cliquant sur l'icône de divulgation. Cette section est réduite par défaut, car normalement vous ne modifierez rien ici. Mais si vous souhaitez voir les domaines et les variables que l'outil prend en compte et tente de créer s'ils n'existent pas, vous pouvez développer la section récapitulative.
La deuxième section est l'endroit où vous spécifiez où trouver vos données d'entrée. Et dans le cas le plus simple, vous travaillerez directement avec un dossier de données d’entrée. Mais si vos données ne sont pas relativement proches de leur forme finale (en d'autres termes, si de nombreuses transformations doivent être effectuées avant de pouvoir utiliser les données dans JMP Clinical), vous avez la possibilité de spécifier ou d'enregistrer un flux de travail. cela créera les fichiers du dossier d'entrée.
La section Données de sortie de l'étude vous permet de spécifier si l'outil de cartographie doit créer uniquement les variables requises qui n'existaient pas ou s'il doit créer des variables facultatives supplémentaires. Si vous choisissez ceci, vous pouvez cliquer sur le bouton Ajouter pour sélectionner les variables que l'outil prendra en compte pour la création.
Vous pouvez spécifier le dossier de sortie, dans lequel l'outil écrira les fichiers résultant du processus de mappage. Il existe une section d'aperçu pour chaque domaine, qui vous indiquera quelles variables vont être créées, et une section qui vous permettra de spécifier les sources de données à partir des données d'entrée pour les nouvelles colonnes de sortie.
Dans la quatrième section, vous pouvez demander à l'outil d'ajouter, d'actualiser ou de mettre à jour automatiquement une étude avec le dossier de sortie de cet outil comme dossier d'entrée pour cette étude. Vous pouvez saisir un nouveau nom d'étude ou sélectionner le nom d'une étude existante. Cliquer sur le bouton Ajouter, Actualiser ou Mettre à jour l'étude lance l'opération de gestion de l'étude appropriée.
Enfin, lorsque tous les paramètres sont en place et que vous les avez testés pour vous assurer qu'ils fonctionnent correctement, vous pouvez enregistrer un modèle qui préserve ces paramètres et pourra être ouvert ultérieurement dans l'outil de cartographie pour vous enregistrer. temps. Et dans le cadre du modèle, vous pouvez même spécifier les tâches qui se produisent lors de son chargement. Par exemple, vous souhaitez peut-être que le modèle exécute automatiquement un flux de travail de saisie et s'arrête là.
Pour plus de détails sur les différents composants de l'outil de mappage de données dans JMP Clinical, veuillez vous référer à la documentation liée sur cette page.
