液体ハンドラー用の DoE 設計をエクスポートするための良い例はありますか?こんにちは、みんな、
液体ハンドラーを使用して少量/高スループットの DoE を行う顧客がいますが、設計を引き継ぐ際に手作業によるエラーやミスが発生するため、設計をロボットに転送する際に問題が発生することがよくあります。JMP を使用して、設計を取得し、「マスター ミックス」(ストック ソリューション) を理解し、ロボットにプロトコルを分配するプロセスを自動化した顧客を誰か知っているか知りたいです。Synthace がこれらの機能の一部を提供していることは知っていますが、Workflow Builder や基本的な JSL などを使用してこれを実現するのが「平均的な」ユーザーにとってどれほど難しいのか興味があります。
乾杯、
ベン
Re: 液体ハンドラー用の DoE 設計をエクスポートするための良い例はありますか?こんにちは、ベン、
適切な情報が得られ、適切な設計構造を提供するためにデータをどのように整理すべきかをユーザーが理解していれば、ワークフロー ビルダーを使用してこれを実行できると思います (ウェル プレートの場合は分割/ストリップ プロットを考えています)。これらの液体ハンドラーが提供する情報の種類と、顧客が使用する一般的な設計を確認できればよいでしょう。
ドン
Re: 液体ハンドラー用の DoE 設計をエクスポートするための良い例はありますか?Christian と私は以前、この同じアプリケーションについて話し合いました。 @christianstopp 、顧客は SPT Labtech だったと思います。彼らがこの問題をどのように解決したか覚えていますか?
Re: 液体ハンドラー用の DoE 設計をエクスポートするための良い例はありますか?こんにちは@Ben_Ingham さん
何年も前、Synthace が利用可能になる前、 Synbicite/London DNA Foundryの David McClymont がこれをやっていました。これらの組織がまだ存在しているのか、その作業が継続されているのかはわかりません。
Dave は別の会社に移り、現在は Revvity に勤務しているようです。彼はまだ JMP を使用していると思います。彼は以前からとても親しみやすい人でした。
Dave は、JMP DOE 命令をロボット命令に変換するのは大変な作業だったと言っていましたが、今では簡単になっているかもしれません。彼がこれにかなりの時間を割くことができたのは幸運だったと思います。平均的な産業科学者なら、おそらく他に優先すべきことがたくさんあるでしょう。
ワークフロー ビルダーがどのように役立つかはわかりません。そのためには少し専門的すぎるように感じます。
お役に立てれば、
フィル
Re: 液体ハンドラー用の DoE 設計をエクスポートするための良い例はありますか?@nick_sheltonと@Ben_Ingham :
ニック、すごい思い出ですね!ベン、もう随分前になりますが、私はこの件について何人かの顧客と、そして JMP パートナーと、実質的にはコストをかけずにツールを探している中小企業向けのツールについて話しました。
顧客デモの後にプロトタイプとして作成したコンテンツをいくつか添付しました。かなり時間が経っていたので、掘り出さなければなりませんでした。ダイアログ ボックスで使用する値など、いくつかの指示は .jsl ファイルにあります。その下にはさらにいくつかあります。これはすべて WFB 以前のことなので、今では実現が簡単になっている可能性があります。
当時の私のメモから:
- SampleData.jmp – 実験設計(いくつかの追加列を含む)(.jmp データ テーブルを除く)
- Liquid Handler Design Conversion.jsl – JSLコードを含むスクリプトファイル
- ForLiquidHandler.csv – 変換後の出力ファイル
スクリプトのワークフロー:
- ユーザーがパラメータ値(設計のウェルプレートサイズ、ストック濃度、最終容量など)を入力するためのダイアログボックスを作成します。
- それぞれの対応するボリュームを生成するために必要な計算を実行します
- 新しいボリュームの列を液体ハンドラーに必要な「ウェル プレート」形式に転置し、出力 .csv ファイルをエクスポートします。
JSL の簡単な使用法 (当時は JSL をまったく知らなかったため、それほど複雑ではないはずです) と例の概要がわかると幸いです。