比較兩個資料集對應處理之間的平均值親愛的跳躍社區，
如果這個問題被問了多次，我很抱歉，我對此完全陌生。
我有兩個資料集（25 度和 40 度），兩者都測量 1000 種蛋白質（蛋白質，標稱）清單的光譜計數（計數，連續），一式三份（A、B、C）。因此，每組都有 25 度 - 蛋白質 1 - 計數 A、B、C。 - 蛋白質566 與40 度顯著不同- 蛋白質566，如果25 度則不是- 蛋白質566 與蛋白質25 度不同- 567。
您能幫我了解如何格式化、輸入和繪製資料嗎？如果涉及任何“堆疊”，我需要如何標記治療？
太感謝了。
一切順利。
基礎資料分析與建模蘋果系統回覆：比較兩個資料集對應處理之間的平均值嗨@AdditiveTiger68 ，
歡迎來到社區！
為了比較兩個不同表中的數據，您需要以堆疊格式組合這兩個資料集，如下所示：
然後，使用圖形產生器，您可以使用 Y 軸中的響應、X 軸中的溫度以及覆蓋變數中的蛋白質 ID 來繪製資料。使用本地資料過濾器可能有助於避免不同蛋白質的過多不同資料和擬合線（如果溫度具有標稱資料類型，則為箱線圖）。
如果您有興趣分析數據，可以使用平台 Fit Y by X： 單向分析 (jmp.com)
然而，由於每種蛋白質和每個溫度只有 3 個值，因此對於執行任何統計測試來說，這似乎是一個非常小的樣本量。
我建議按蛋白質單獨繪製數據，檢查模式，並（謹慎）使用 Fit Y by X 平台分析整個數據集，看看您是否有一個可能對響應變化具有統計顯著性的總體趨勢取決於溫度。請檢查您的資料是否符合您要使用的測試的假設（方差同質性、分佈常態性和參數測試的獨立觀察值）：
您可能也對多重比較的混合模型感興趣： 多重比較 (jmp.com)
根據您的目標，如果您的目標是確定不同蛋白質的反應變化是否仍在可接受的等效值範圍內（差異以0 為中心，+/- delta 被認為是可接受的），您可能還會對等效性測試有興趣。
如您所看到的，根據您的資料和目標，存在多種可能性，因此 JMP 中可能有多個符合您需求的選項。
我附上了範例資料表，以便您可以看到這些不同的選項。
希望這個回答對你有幫助
回覆：比較兩個資料集對應處理之間的平均值您需要做的第一件事是轉到本頁頂部的“學習 JMP”選項並瀏覽“入門”部分以熟悉 JMP 的工作原理，然後轉到“JMP 分析功能”部分。
我也會搜尋過去的討論，尋找可能與您的分析相關的項目。
當您回到此討論時，如果您能提供您擁有的 2 個數據表的範例，也會非常有幫助。擁有實際樣本可以讓 JMP 社群的成員更輕鬆地形象化問題並提出解決方案。
回覆：比較兩個資料集對應處理之間的平均值嗨維克多，
非常感謝您的回覆以及您投入的時間。
我已經能夠透過 fit y by x 來堆疊和繪製數據。現在我需要取得每種蛋白質在兩個不同溫度下的相關 p 值。從你的例子來看，那就是：
蛋白質 566 25 與 40 p 值
蛋白質 567 25 與 40 p 值
蛋白質 568 25 與 40 p 值
我在 fit y by x 中嘗試了“By”，但最終得到了很多單獨的圖。由於我有 1,000 多種蛋白質，我希望有一個功能可以為我提供表格中所需的所有 p 值。
我也嘗試過入門教程，但我沒有足夠的經驗來自己解決這個問題。
再次感謝你！
回覆：比較兩個資料集對應處理之間的平均值「透過 X 擬合 Y」平台中的「依據」方塊指示 JMP 對「依據」方塊中的每個值進行不同的分析。我認為您想要的是“By”變數為“Temperature”。如果是這樣，請確保它是標稱的（因此有兩組而不是連續的刻度）並將溫度放入平台的 X 框中。不要在“By”框中放置任何內容。
