Compare medias entre tratamientos correspondientes en DOS conjuntos de datosQuerida comunidad de salto,
Pido disculpas si la pregunta se ha hecho varias veces, soy completamente nuevo en esto.
Tengo dos conjuntos de datos (25 grados y 40 grados), ambos miden recuentos espectrales (Recuentos, continuos) de una lista de 1000 proteínas (Proteínas, nominales) por triplicado (A, B, C). Entonces, cada conjunto tendría 25 grados - proteína 1 - recuentos A, B, C. 40 grados - proteína 1 - recuentos A, B, C. Me gustaría comparar las medias de cada medición de recuento entre temperaturas, es decir, 25 grados. - proteína 566 significativamente diferente de 40 grados - proteína 566 y NO si 25 grados - proteína 566 es diferente de proteína 25 grados - 567.
¿Podría ayudarme sobre cómo formatear, escribir y trazar los datos? Si hay algún "apilamiento" involucrado, ¿cómo debo etiquetar los tratamientos?
Muchas gracias.
Mis mejores deseos.
Análisis y modelado de datos básicosMac OSRe: Comparar medias entre tratamientos correspondientes en DOS conjuntos de datosHola @AdditiveTiger68 ,
¡Bienvenidos a la Comunidad!
Para comparar los datos de dos tablas diferentes, deberá combinar estos dos conjuntos de datos en un formato apilado, como este:
Luego, usando Graph Builder, puede trazar sus datos usando su Respuesta en el eje Y, la Temperatura en el eje X y la ID de proteína como variable de Superposición. El uso de un filtro de datos local puede ayudar a evitar demasiados datos y líneas de ajuste diferentes (o diagramas de caja si la temperatura tiene un tipo de datos nominal) para diferentes proteínas.
Si está interesado en analizar sus datos, puede utilizar Platform Fit Y by X: Oneway Analysis (jmp.com)
Sin embargo, dado que solo tiene 3 valores para cada proteína y para cada temperatura, este parece ser un tamaño de muestra muy bajo para realizar pruebas estadísticas.
Recomendaría trazar sus datos individualmente por proteínas, para verificar patrones y (con precaución) analizar todo el conjunto de datos con la plataforma Fit Y by X, para ver si tiene una tendencia general que pueda ser estadísticamente significativa para el cambio en la respuesta. dependiendo de la temperatura. Verifique que sus datos respeten los supuestos de la prueba que desea utilizar (homogeneidad de la varianza, normalidad de la distribución y observación independiente para la prueba paramétrica):
También podría interesarte Modelos mixtos para comparaciones múltiples: Comparaciones múltiples (jmp.com)
Dependiendo de su objetivo, también podría interesarle la prueba de equivalencia si su objetivo es determinar que la variación de la respuesta para diferentes proteínas todavía se encuentra en un rango de valores equivalente aceptable (diferencia centrada en 0, con +/- delta considerado aceptable) .
Como puedes ver, hay muchas posibilidades dependiendo de tus datos y tus objetivos, por lo que puedes tener varias opciones en JMP que se correspondan con tus necesidades.
Adjunté la tabla de datos de ejemplo para que puedas ver estas diferentes opciones.
Espero que esta respuesta te ayude,
Re: Comparar medias entre tratamientos correspondientes en DOS conjuntos de datosLo primero que debe hacer es ir a la selección "Aprender JMP" en la parte superior de esta página y pasar por la sección "Cómo comenzar" para familiarizarse con cómo funciona JMP, luego pasar a la sección "Capacidades analíticas de JMP". .
También buscaría en las discusiones anteriores elementos que puedan ser relevantes para su análisis.
Cuando regrese a esta discusión, también será muy útil si puede proporcionar una muestra de las 2 tablas de datos que tiene. Tener muestras reales hace que sea mucho más fácil para los miembros de la comunidad JMP visualizar el problema y encontrar soluciones.
Re: Comparar medias entre tratamientos correspondientes en DOS conjuntos de datosHi Victor,
Muchas gracias por tu respuesta y por dedicar tu tiempo a esto.
Pude apilar y trazar los datos ajustando y por x. Ahora necesito obtener los valores de p asociados para cada proteína en las dos temperaturas diferentes. Saliendo de tu ejemplo, eso sería:
Proteína 566 Valor p 25 frente a 40
Proteína 567 25 vs 40 valor p
Proteína 568 Valor p 25 frente a 40
Intenté "Por" en fit y by x pero termino con muchas tramas individuales. Como tengo más de 1000 proteínas, esperaba una función que pudiera proporcionarme todos los valores p necesarios en una tabla.
También intenté tutoriales de introducción, pero no tengo la experiencia suficiente para resolver esto por mi cuenta.
¡Muchas gracias de nuevo!
Re: Comparar medias entre tratamientos correspondientes en DOS conjuntos de datosEl cuadro "Por" en la plataforma Fit Y by X le indica a JMP que realice un análisis diferente para cada valor en el cuadro Por. Lo que creo que quieres es que la variable Por sea Temperatura. Si es así, asegúrese de que sea nominal (para que haya dos grupos en lugar de una escala continua) y coloque Temperatura en el cuadro X de la plataforma. No pongas nada en el cuadro Por.
