比较两个数据集中相应治疗的平均值亲爱的跳跃社区，
如果这个问题被问过多次，我深感抱歉，因为我对此完全陌生。
我有两个数据集（25 度和 40 度），它们都测量了 1000 种蛋白质（蛋白质，名义）的光谱计数（计数，连续），一式三份（A、B、C）。因此，每组都有 25 度 - 蛋白质 1 - 计数 A、B、C。40 度 - 蛋白质 1 - 计数 A、B、C。我想比较不同温度下每个计数测量值的平均值，即 25 度 - 蛋白质 566 与 40 度 - 蛋白质 566 是否有显著差异，而不是 25 度 - 蛋白质 566 与蛋白质 25 度 - 567 是否有差异。
您能帮我格式化、输入和绘制数据吗？如果涉及任何“堆叠”，我需要如何标记处理？
太感谢了。
一切顺利。
基础数据分析与建模苹果系统回复：比较两个数据集中相应治疗的平均值你好@AdditiveTiger68 ，
欢迎加入社区！
为了比较来自两个不同表的数据，您需要将这两个数据集以堆叠格式组合起来，如下所示：
然后，使用 Graph Builder，您可以使用 Y 轴上的响应、X 轴上的温度和覆盖变量上的蛋白质 ID 来绘制数据。使用本地数据过滤器可能有助于避免不同蛋白质的数据和拟合线（或箱线图，如果温度具有名义数据类型）有太多不同。
如果您有兴趣分析数据，可以使用平台“拟合 Y 与 X： 单向分析”（jmp.com）
但是，由于每种蛋白质和每种温度只有 3 个值，因此运行任何统计测试的样本量似乎都非常小。
我建议按蛋白质单独绘制数据，以检查模式，并（谨慎地）使用 Fit Y by X 平台分析整个数据集，看看您是否有一个总体趋势，该趋势可能对响应随温度的变化具有统计意义。请检查您的数据是否符合您要使用的测试的假设（方差同质性、分布的正态性和参数测试的独立观察）：
您可能还对多重比较的混合模型感兴趣： 多重比较 (jmp.com)
根据您的目标，如果您的目标是确定不同蛋白质的反应变化仍然在可接受的等效值范围内（差异以 0 为中心，+/- delta 被认为是可以接受的），那么您可能还会对等效性检验感兴趣。
如您所见，根据您的数据和目标，有很多可能性，因此您可能在 JMP 中有几个符合您需求的选项。
我附加了示例数据表，以便您可以看到这些不同的选项。
希望这个答案能帮助你，
回复：比较两个数据集中相应治疗的平均值您需要做的第一件事是转到此页面顶部的“学习 JMP”选项并浏览“入门”部分以熟悉 JMP 的工作原理，然后转到“JMP 分析功能”部分。
我还会在过去的讨论中搜索可能与您的分析相关的内容。
当您回到此讨论时，如果您可以提供您拥有的 2 个数据表的样本，也会非常有帮助。拥有实际样本可以让 JMP 社区的成员更轻松地直观地了解问题并提出解决方案。
回复：比较两个数据集中相应治疗的平均值嗨维克多，
非常感谢您的回复以及您为此所付出的时间。
我已经能够通过 fit y by x 堆叠和绘制数据。现在我需要获取两种不同温度下每种蛋白质的相关 p 值。根据您的示例，这将是：
蛋白质 566 25 vs 40 p 值
蛋白质 567 25 vs 40 p 值
蛋白质 568 25 vs 40 p 值
我尝试在 fit y by x 中使用“By”，但最终只得到了许多单独的图。由于我有 1,000 多种蛋白质，我希望有一个功能可以在表格中提供我所需的所有 p 值。
我也尝试过入门教程，但我没有足够的经验来独自解决这个问题。
再次感谢你！
回复：比较两个数据集中相应治疗的平均值“以 X 拟合 Y”平台中的“按”框指示 JMP 对“按”框中的每个值进行不同的分析。我认为您希望按变量为温度。如果是这样，请确保它是名义的（因此有两个组而不是连续的尺度），并将温度放在平台的 X 框中。不要在“按”框中输入任何内容。
