2つのデータセット間で対応する治療の平均を比較するジャンプコミュニティの皆様へ
同じ質問が何度も出されている場合は申し訳ありませんが、私はこの分野に全く不慣れです。
2 つのデータセット (25 度と 40 度) があり、どちらも 1000 個のタンパク質 (タンパク質、名目値) のリストのスペクトル カウント (カウント、連続) を 3 回 (A、B、C) 測定しています。したがって、各セットには、25 度 - タンパク質 1 - カウント A、B、C、40 度 - タンパク質 1 - カウント A、B、C が含まれます。温度間で各カウント測定の平均を比較したいのですが、つまり、25 度 - タンパク質 566 は 40 度 - タンパク質 566 と有意に異なるか、25 度 - タンパク質 566 がタンパク質 25 度 - 567 と異なるかどうかは比較しません。
データのフォーマット、入力、プロット方法について教えていただけますか? 「スタッキング」が含まれる場合、処理にラベルを付けるにはどうすればよいですか?
どうもありがとう。
ではごきげんよう。
基本的なデータ分析とモデリングマックOSRe: 2 つのデータセット間で対応する処理の平均を比較するこんにちは@AdditiveTiger68 、
コミュニティへようこそ！
2 つの異なるテーブルのデータを比較するには、次のように 2 つのデータセットを積み重ねた形式で結合する必要があります。
次に、グラフ ビルダーを使用して、応答を Y 軸、温度を X 軸、タンパク質 ID をオーバーレイ変数として使用してデータをプロットできます。ローカル データ フィルターを使用すると、さまざまなタンパク質に対してあまりにも多くの異なるデータや適合線 (または温度が名目データ タイプである場合はボックス プロット) が表示されるのを防ぐことができます。
データの分析に興味がある場合は、プラットフォーム Fit Y by X: Oneway Analysis (jmp.com)を使用できます。
ただし、各タンパク質と各温度に対して 3 つの値しかないため、統計テストを実行するにはサンプル サイズが小さすぎるようです。
パターンを確認するために、タンパク質ごとにデータを個別にプロットし、（注意しながら）Fit Y by X プラットフォームでデータセット全体を分析して、温度に応じた応答の変化について統計的に有意な一般的な傾向があるかどうかを確認することをお勧めします。データが、使用するテストの仮定（分散の均一性、分布の正規性、パラメトリック テストの独立した観察）を尊重していることを確認してください。
多重比較のための混合モデル: 多重比較 (jmp.com)も興味深いかもしれません。
目的に応じて、異なるタンパク質に対する応答の変動が依然として許容可能な同等の値の範囲内にあること（差は 0 を中心とし、+/- デルタは許容可能と見なされる）を判断することが目的である場合は、同等性テストにも興味があるかもしれません。
ご覧のとおり、データと目的に応じてさまざまな可能性があり、JMP にはニーズに対応する複数のオプションがある可能性があります。
これらのさまざまなオプションを確認できるように、サンプルのデータテーブルを添付しました。
この回答がお役に立てば幸いです。
Re: 2 つのデータセット間で対応する処理の平均を比較するまず最初に、このページの上部にある「JMP の学習」セクションに移動し、「はじめに」セクションを読んで JMP の仕組みを理解してから、「JMP の分析機能」セクションに進みます。
また、過去のディスカッションを検索して、分析に関連する可能性のある項目を探すこともできます。
このディスカッションに戻るときに、お持ちの 2 つのデータ テーブルのサンプルを提供していただけると非常に助かります。実際のサンプルがあれば、JMP コミュニティのメンバーが問題を視覚化し、解決策を見つけやすくなります。
Re: 2 つのデータセット間で対応する処理の平均を比較するこんにちは、ビクターさん
ご返信、そしてお時間を割いていただき誠にありがとうございます。
データを y と x のフィットで積み重ねてプロットできました。次に、2 つの異なる温度における各タンパク質の関連する p 値を取得する必要があります。あなたの例からすると、次のようになります。
タンパク質 566 25 vs 40 p値
タンパク質 567 25 vs 40 p値
タンパク質 568 25 vs 40 p値
fit y by x で「By」を試してみましたが、結局は個別のプロットがたくさんできてしまいます。1,000 を超えるタンパク質があるので、必要なすべての p 値を表に表示できる機能を求めていました。
入門チュートリアルも試してみましたが、自分で解決できるほど経験が足りません。
本当にありがとうございました！
Re: 2 つのデータセット間で対応する処理の平均を比較するFit Y by X プラットフォームの「By」ボックスは、By ボックス内の各値に対して異なる分析を実行するように JMP に指示します。By 変数が温度である必要があると思います。その場合、それが名目値 (連続スケールではなく 2 つのグループ) であることを確認し、プラットフォームの X ボックスに温度を入力します。By ボックスには何も入力しないでください。
