Confrontare le medie tra i trattamenti corrispondenti in DUE set di datiCara comunità del salto,
Mi scuso se la domanda è stata posta più volte, sono completamente nuovo in materia.
Ho due set di dati (25 gradi e 40 gradi) che misurano entrambi i conteggi spettrali (Conteggi, continui) di un elenco di 1000 proteine (Proteine, nominali) in triplicato (A, B, C). Quindi, ogni set avrebbe 25 gradi - proteina 1 - conta A, B, C. 40 gradi - proteina 1 - conta A, B, C. Vorrei confrontare le medie di ciascuna misurazione del conteggio alle diverse temperature, ovvero è 25 gradi - proteina 566 significativamente diversa da 40 gradi - proteina 566 e NON se 25 gradi - proteina 566 è diversa da proteina 25 gradi - 567.
Potete per favore aiutarmi su come formattare, digitare e tracciare i dati? Se è coinvolto qualche "impilamento", come devo etichettare i trattamenti?
Grazie mille.
Ti auguro il meglio.
Analisi e modellazione dei dati di baseMac OSRi: Confrontare le medie tra i trattamenti corrispondenti su DUE set di datiCiao @AdditiveTiger68 ,
Benvenuto nella Comunità!
Per confrontare i tuoi dati da due tabelle diverse, dovrai combinare questi due set di dati in un formato in pila, in questo modo:
Quindi, utilizzando il Costruttore di grafici, puoi tracciare i dati utilizzando la risposta sull'asse Y, la temperatura sull'asse X e l'ID proteina come variabile di sovrapposizione. L'utilizzo di un filtro dati locale può aiutare a evitare dati e linee di adattamento troppo diversi (o box plot se la temperatura ha un tipo di dati nominale) per proteine diverse.
Se sei interessato ad analizzare i tuoi dati, puoi utilizzare la piattaforma Fit Y by X: Oneway Analysis (jmp.com)
Tuttavia, poiché sono disponibili solo 3 valori per ciascuna proteina e per ciascuna temperatura, la dimensione del campione sembra essere molto bassa per eseguire qualsiasi test statistico.
Consiglierei di tracciare i dati individualmente per proteine, per verificare la presenza di modelli e (con cautela) di analizzare l'intero set di dati con la piattaforma Fit Y by X, per vedere se si dispone di una tendenza generale che potrebbe essere statisticamente significativa per il cambiamento nella risposta a seconda della temperatura. Verifica che i tuoi dati rispettino le ipotesi del test che desideri utilizzare (omogeneità della varianza, normalità della distribuzione e osservazione indipendente per il test parametrico):
Potrebbe interessarti anche Modelli misti per confronti multipli: confronti multipli (jmp.com)
A seconda del tuo obiettivo, potresti anche essere interessato al test di equivalenza se il tuo obiettivo è determinare che la variazione della risposta per diverse proteine è ancora in un intervallo di valori equivalenti accettabili (differenza centrata su 0, con +/- delta considerato accettabile) .
Come puoi vedere, ci sono molte possibilità a seconda dei tuoi dati e dei tuoi obiettivi, quindi potresti avere diverse opzioni in JMP che corrispondono alle tue esigenze.
Ho allegato il datatable di esempio in modo che tu possa vedere queste diverse opzioni.
Spero che questa risposta ti possa aiutare,
Ri: Confrontare le medie tra i trattamenti corrispondenti su DUE set di datiLa prima cosa che devi fare è andare alla selezione "Impara JMP" nella parte superiore di questa pagina e passare alla sezione "Per iniziare" per familiarizzare con il funzionamento di JMP, quindi passare alla sezione "Funzionalità analitiche di JMP" .
Vorrei anche cercare nelle discussioni precedenti elementi che potrebbero essere rilevanti per la tua analisi.
Quando tornerai su questa discussione, sarà molto utile anche se puoi fornire un esempio delle 2 tabelle di dati che hai. Disporre di campioni reali rende molto più semplice per i membri della comunità JMP visualizzare il problema e trovare soluzioni.
Ri: Confrontare le medie tra i trattamenti corrispondenti su DUE set di datiCiao Vittorio,
Grazie mille per la tua risposta e per aver dedicato il tuo tempo a questo.
Sono stato in grado di impilare e tracciare i dati tramite fit y per x. Ora devo ottenere i valori p associati per ciascuna proteina alle due diverse temperature. Uscendo dal tuo esempio, sarebbe:
Proteina 566 Valore p 25 vs 40
Proteina 567 Valore p 25 vs 40
Proteina 568 Valore p 25 vs 40
Ho provato "By" in fit y by x ma alla fine mi ritrovo con molte trame individuali. Dato che ho più di 1.000 proteine, speravo in una funzionalità che potesse darmi tutti i valori p necessari in una tabella.
Ho anche provato i tutorial iniziali, ma non ho abbastanza esperienza per risolverlo da solo.
Grazie mille, ancora!
Ri: Confrontare le medie tra i trattamenti corrispondenti su DUE set di datiLa casella "Per" nella piattaforma Adatta Y rispetto a X indica a JMP di eseguire un'analisi diversa per ciascun valore nella casella Per. Quello che penso che tu voglia è che la variabile By sia Temperatura. Se è così, assicurati che sia nominale (quindi ci sono due gruppi anziché una scala continua) e inserisci Temperatura nella casella X della piattaforma. Non inserire nulla nella casella Per.
