Vergleichen Sie Mittelwerte zwischen entsprechenden Behandlungen in ZWEI DatensätzenLiebe Jump-Community,
Es tut mir leid, wenn die Frage bereits mehrfach gestellt wurde, ich bin auf diesem Gebiet völlig neu.
Ich habe zwei Datensätze (25 Grad und 40 Grad), die beide spektrale Zählungen (Zählungen, kontinuierlich) einer Liste von 1000 Proteinen (Proteine, nominal) in dreifacher Ausfertigung (A, B, C) messen. Jeder Satz hätte also 25 Grad – Protein 1 – Zählungen A, B, C. 40 Grad – Protein 1 – Zählungen A, B, C. Ich möchte die Mittelwerte jeder Zählungsmessung über verschiedene Temperaturen hinweg vergleichen, d. h. ist 25 Grad – Protein 566 signifikant verschieden von 40 Grad – Protein 566 und NICHT, wenn 25 Grad – Protein 566 sich von Protein 25 Grad – 567 unterscheidet.
Können Sie mir bitte helfen, die Daten zu formatieren, einzugeben und darzustellen? Wenn eine „Stapelung“ erfolgt, wie muss ich die Behandlungen kennzeichnen?
Vielen Dank.
Alles Gute.
Grundlegende Datenanalyse und ModellierungMac OSBetreff: Mittelwerte zwischen entsprechenden Behandlungen in ZWEI Datensätzen vergleichenHallo @AdditiveTiger68 ,
Willkommen in der Community!
Um Ihre Daten aus zwei verschiedenen Tabellen zu vergleichen, müssen Sie diese beiden Datensätze in einem gestapelten Format wie folgt kombinieren:
Anschließend können Sie mit Graph Builder Ihre Daten mit Ihrer Antwort auf der Y-Achse, der Temperatur auf der X-Achse und der Protein-ID als Overlay-Variable darstellen. Die Verwendung eines lokalen Datenfilters kann dazu beitragen, zu viele unterschiedliche Daten und Anpassungslinien (oder Boxplots, wenn die Temperatur einen nominalen Datentyp hat) für unterschiedliche Proteine zu vermeiden.
Wenn Sie an der Analyse Ihrer Daten interessiert sind, können Sie die Plattform „Fit Y by X: Oneway Analysis“ (jmp.com) verwenden.
Da Ihnen jedoch nur drei Werte für jedes Protein und jede Temperatur zur Verfügung stehen, scheint dies eine sehr geringe Stichprobengröße für die Durchführung statistischer Tests zu sein.
Ich würde empfehlen, Ihre Daten einzeln nach Proteinen aufzuzeichnen, um nach Mustern zu suchen, und (mit Vorsicht) den gesamten Datensatz mit der Plattform Fit Y by X zu analysieren, um zu sehen, ob Sie einen allgemeinen Trend haben, der für die Änderung der Reaktion je nach Temperatur statistisch signifikant sein könnte. Bitte überprüfen Sie, ob Ihre Daten die Annahmen des Tests erfüllen, den Sie verwenden möchten (Varianzhomogenität, Normalität der Verteilung und unabhängige Beobachtung für parametrischen Test):
Vielleicht interessiert Sie auch: Gemischte Modelle für Mehrfachvergleiche: Mehrfachvergleiche (jmp.com)
Abhängig von Ihrem Ziel könnten Sie auch an einem Äquivalenztest interessiert sein, wenn Ihr Ziel darin besteht, festzustellen, ob die Abweichungen in den Reaktionen bei unterschiedlichen Proteinen noch immer in einem akzeptablen äquivalenten Wertebereich liegen (Differenz zentriert auf 0, wobei +/- Delta als akzeptabel angesehen wird).
Wie Sie sehen, gibt es je nach Ihren Daten und Zielen zahlreiche Möglichkeiten, sodass Ihnen in JMP möglicherweise mehrere Optionen zur Verfügung stehen, die Ihren Anforderungen entsprechen.
Damit Sie diese verschiedenen Optionen sehen können, habe ich die Beispieldatentabelle angehängt.
Hoffe, diese Antwort wird Ihnen helfen,
Betreff: Mittelwerte zwischen entsprechenden Behandlungen in ZWEI Datensätzen vergleichenGehen Sie zunächst oben auf dieser Seite zur Auswahl „JMP lernen“ und lesen Sie den Abschnitt „Erste Schritte“, um sich mit der Funktionsweise von JMP vertraut zu machen. Fahren Sie dann mit dem Abschnitt „Analysefunktionen von JMP“ fort.
Ich würde auch die vergangenen Diskussionen nach Elementen durchsuchen, die für Ihre Analyse relevant sein könnten.
Wenn Sie zu dieser Diskussion zurückkehren, ist es auch sehr hilfreich, wenn Sie ein Beispiel der beiden Datentabellen bereitstellen können, die Sie haben. Mit tatsächlichen Beispielen können die Mitglieder der JMP-Community das Problem viel einfacher visualisieren und Lösungen finden.
Betreff: Mittelwerte zwischen entsprechenden Behandlungen in ZWEI Datensätzen vergleichenHallo Victor,
Vielen Dank für Ihre Antwort und dafür, dass Sie sich die Zeit dafür genommen haben.
Ich konnte die Daten stapeln und darstellen, indem ich y mal x anpasste. Jetzt muss ich die zugehörigen p-Werte für jedes Protein bei den beiden unterschiedlichen Temperaturen ermitteln. Ausgehend von Ihrem Beispiel wäre das:
Protein 566 25 vs 40 p-Wert
Protein 567 25 vs 40 p-Wert
Protein 568 25 vs 40 p-Wert
Ich habe „By“ in „y by x fit“ ausprobiert, aber am Ende habe ich nur viele einzelne Diagramme. Da ich mehr als 1.000 Proteine habe, hoffte ich auf eine Funktion, die mir alle benötigten p-Werte in einer Tabelle liefern kann.
Ich habe auch die Einführungstutorials ausprobiert, bin jedoch nicht erfahren genug, um das Problem alleine zu lösen.
Nochmal vielen Dank!
Betreff: Mittelwerte zwischen entsprechenden Behandlungen in ZWEI Datensätzen vergleichenDas Feld „Nach“ in der Plattform „Y nach X anpassen“ weist JMP an, für jeden Wert im Feld „Nach“ eine andere Analyse durchzuführen. Ich denke, Sie möchten, dass die Variable „Nach“ die Temperatur ist. Stellen Sie in diesem Fall sicher, dass sie nominal ist (es gibt also zwei Gruppen und keine kontinuierliche Skala) und geben Sie „Temperatur“ in das Feld „X“ der Plattform ein. Geben Sie nichts in das Feld „Nach“ ein.
