Comparez les moyennes entre les traitements correspondants sur DEUX ensembles de donnéesChère communauté de saut,
Je m'excuse si la question a été posée plusieurs fois, je suis complètement nouveau dans ce domaine.
J'ai deux ensembles de données (25 degrés et 40 degrés) mesurant tous deux des comptes spectraux (comptes, continus) d'une liste de 1000 protéines (protéines, nominales) en triple (A, B, C). Ainsi, chaque ensemble aurait 25 degrés - protéine 1 - comptes A, B, C. 40 degrés - protéine 1 - comptes A, B, C. Je voudrais comparer les moyennes de chaque mesure de compte en fonction des températures, c'est-à-dire 25 degrés. - protéine 566 significativement différente de 40 degrés - protéine 566 et NON si 25 degrés - la protéine 566 est différente de la protéine 25 degrés - 567.
Pouvez-vous s'il vous plaît m'aider sur la façon de formater, saisir et tracer les données ? S’il y a un « empilement », comment dois-je étiqueter les traitements ?
Merci beaucoup.
Tous mes vœux.
Analyse et modélisation des données de basemacOSRe : Comparer les moyennes entre les traitements correspondants sur DEUX ensembles de donnéesSalut @AdditiveTiger68 ,
Bienvenue dans la Communauté !
Afin de comparer vos données de deux tables différentes, vous devrez combiner ces deux ensembles de données dans un format empilé, comme ceci :
Ensuite, à l'aide de Graph Builder, vous pouvez tracer vos données en utilisant votre réponse sur l'axe Y, la température comme axe X et l'ID de protéine comme variable de superposition. L’utilisation d’un filtre de données local peut aider à éviter trop de données et de lignes d’ajustement différentes (ou des boîtes à moustaches si la température a un type de données nominal) pour différentes protéines.
Si vous souhaitez analyser vos données, vous pouvez utiliser la Platform Fit Y by X : Oneway Analysis (jmp.com)
Cependant, comme vous ne disposez que de 3 valeurs pour chaque protéine et pour chaque température, cela semble être une taille d'échantillon très faible pour effectuer des tests statistiques.
Je recommanderais de tracer vos données individuellement par protéines, pour vérifier les modèles et (avec prudence) d'analyser l'ensemble des données avec la plateforme Fit Y by X, pour voir si vous avez une tendance générale qui peut être statistiquement significative pour le changement de réponse. en fonction de la température. Veuillez vérifier que vos données respectent bien les hypothèses du test que vous souhaitez utiliser (homogénéité de la variance, normalité de la distribution et observation indépendante pour le test paramétrique) :
Vous pourriez également être intéressé par Modèles mixtes pour comparaisons multiples : Comparaisons multiples (jmp.com)
En fonction de votre objectif, vous pourriez également être intéressé par un test d'équivalence si votre objectif est de déterminer que la variation de réponse pour différentes protéines se situe toujours dans une plage de valeurs équivalentes acceptable (différence centrée sur 0, avec +/- delta considéré comme acceptable) .
Comme vous pouvez le constater, il existe de nombreuses possibilités en fonction de vos données et de vos objectifs, vous pouvez donc avoir plusieurs options dans JMP qui correspondent à vos besoins.
J'ai joint l'exemple de datatable afin que vous puissiez voir ces différentes options.
J'espère que cette réponse vous aidera,
Re : Comparer les moyennes entre les traitements correspondants sur DEUX ensembles de donnéesLa première chose que vous devez faire est d'accéder à la sélection « Apprendre JMP » en haut de cette page et de parcourir la section « Mise en route » pour vous familiariser avec le fonctionnement de JMP, puis de passer à la section « Capacités analytiques de JMP ». .
Je rechercherais également dans les discussions passées les éléments susceptibles d'être pertinents pour votre analyse.
Lorsque vous reviendrez à cette discussion, il sera également très utile si vous pouvez fournir un échantillon des 2 tableaux de données dont vous disposez. Disposer d'échantillons réels permet aux membres de la communauté JMP de visualiser beaucoup plus facilement le problème et de trouver des solutions.
Re : Comparer les moyennes entre les traitements correspondants sur DEUX ensembles de donnéesSalut Victor,
Merci beaucoup pour votre réponse et pour le temps que vous y consacrez.
J'ai pu empiler et tracer les données via fit y by x. Je dois maintenant obtenir les valeurs p associées pour chaque protéine aux deux températures différentes. En partant de votre exemple, cela donnerait :
Protéine 566 25 vs 40 valeur p
Protéine 567 25 vs 40 valeur p
Protéine 568 25 vs 40 valeur p
J'ai essayé "By" dans fit y by x mais je me retrouve avec beaucoup d'intrigues individuelles. Comme je possède plus de 1 000 protéines, j’espérais une fonctionnalité capable de me donner toutes les valeurs p nécessaires dans un tableau.
J'ai également essayé des didacticiels de démarrage, mais je n'ai pas suffisamment d'expérience pour résoudre ce problème par moi-même.
Merci beaucoup encore une fois!
Re : Comparer les moyennes entre les traitements correspondants sur DEUX ensembles de donnéesLa zone « Par » de la plateforme Ajuster Y par X demande à JMP d'effectuer une analyse différente pour chaque valeur de la zone Par. Ce que je pense que vous voulez, c'est que la variable By soit Température. Si c'est le cas, assurez-vous qu'elle est nominale (il y a donc deux groupes plutôt qu'une échelle continue) et mettez Température dans la case X de la plateforme. Ne mettez rien dans la case Par.
