帮助进行方差分析、效应和多重比较你好,
我正在尝试对我们实验室的数据集进行方差分析。简而言之,我们将 3 种不同大小的粒子以 2 种不同的剂量暴露于一些细胞,并测量基因表达。
我遇到的问题是,当我执行方差分析时,它总是给出剂量错误,并且不给出 P 值。因此,我无法对多重比较运行 Tukeys-HSD 事后分析并查看粒子*剂量相互作用。
我将基因表达设置为数值/连续,将颗粒大小设置为字符/标称,将剂量设置为数值/连续。对于模型对话框,我将基因表达设置为 Y 变量,将颗粒大小、剂量和颗粒大小*剂量设置为模型效果。
根据这些参数,我得到了以下输出(见截图)。我尝试了此设置的几种变体,甚至尝试使用 R 来解决问题,而我自己/其他人得到了相同的结果。
任何帮助是极大的赞赏。
谢谢
基础数据分析与建模数据探索与可视化回复:帮助进行方差分析、效果和多重比较似乎模型无法估计相互作用项,因为您的对照没有像其他粒度级别那样以多剂量运行。我看到了三种可能的行动方案:
1)从模型中删除交互项
2)通过排除控制运行来从数据中删除它们(也可以隐藏,但也可能不隐藏,这取决于您想要看到的内容)
3) 将不同剂量水平的对照添加到数据表中。
您采取的行动将取决于您希望获得的有关控制粒度与其他粒度相比的信息。