Aiuto con Anova, effetti e confronti multipliCiao,
Sto cercando di eseguire un Anova su un set di dati che ho dal nostro laboratorio. In breve, abbiamo esposto alcune particelle a 3 dimensioni diverse ad alcune cellule a 2 dosi diverse e abbiamo misurato l'espressione genica.
Il problema che sto riscontrando è che quando vado a eseguire il mio Anova continua a darmi un errore per la mia dose e non mi dà un valore P per questo. Di conseguenza, non posso eseguire un post-hoc Tukeys-HSD per i miei confronti multipli e osservare le interazioni particella*dose.
La mia espressione genica è numerica/continua, la dimensione delle particelle è carattere/nominale e la mia dose è numerica/continua. Per la finestra di dialogo del modello ho la mia espressione genica come variabile Y e dimensione delle particelle, dose e dimensione delle particelle*Dose come effetti del modello.
In base a questi parametri ottengo il seguente output (vedi screenshot). Ho provato diverse varianti di questa configurazione e ho anche tentato di risolvere il problema utilizzando R e io stesso/altri abbiamo ottenuto gli stessi risultati.
Qualsiasi aiuto è molto apprezzato.
Grazie
Analisi e modellazione dei dati di baseEsplorazione e visualizzazione dei datiRi: Aiuto con Anova, effetti e confronti multipliSembra che il modello non possa stimare il termine di interazione perché il controllo non è stato eseguito a dosi multiple come gli altri livelli di dimensione delle particelle. Vedo tre possibili linee d'azione:
1) Rimuovere il termine di interazione dal modello
2) Rimuovere le corse di controllo dai dati escludendole (e magari nascondendole anche, ma magari non nascondendole a seconda di cosa si vuole vedere)
3) Aggiungi diversi livelli di dosaggio del tuo controllo alla tabella dei dati.
La linea di condotta da intraprendere dipenderà dalle informazioni che si desidera ottenere sulla dimensione delle particelle di controllo rispetto alle altre dimensioni delle particelle.
