Hilfe zu Anova, Effekten und MehrfachvergleichenHallo,
Ich versuche, eine Anova mit einem Datensatz aus unserem Labor durchzuführen. Kurz gesagt, wir haben einige Zellen in zwei verschiedenen Dosen einigen Partikeln in drei verschiedenen Größen ausgesetzt und die Genexpression gemessen.
Das Problem, auf das ich stoße, ist, dass ich beim Durchführen meiner Anova immer einen Fehler für meine Dosis erhalte und keinen P-Wert dafür. Daher kann ich für meine Mehrfachvergleiche keinen Tukeys-HSD-Post-hoc ausführen und die Wechselwirkungen zwischen Partikeln und Dosis betrachten.
Ich habe meinen Genexpression als numerisch/kontinuierlich, die Partikelgröße als charakterlich/nominal und meine Dosis als numerisch/kontinuierlich. Für den Modelldialog habe ich meinen Genexpression als meine Y-Variable und Partikelgröße, Dosis und Partikelgröße*Dosis als meine Modelleffekte.
Basierend auf diesen Parametern erhalte ich die folgende Ausgabe (siehe Screenshots). Ich habe mehrere Variationen dieses Setups ausprobiert und sogar versucht, das Problem mit R zu lösen, und ich/andere erhalten dieselben Ergebnisse.
Jede Hilfe wird sehr geschätzt.
Danke
Grundlegende Datenanalyse und ModellierungDatenexploration und -visualisierungBetreff: Hilfe zu Anova, Effekten und MehrfachvergleichenEs scheint, als ob das Modell den Interaktionsterm nicht schätzen kann, da Ihre Kontrolle nicht wie die anderen Partikelgrößenniveaus mit mehreren Dosen durchgeführt wurde. Ich sehe drei mögliche Vorgehensweisen:
1) Entfernen Sie den Interaktionsterm aus dem Modell
2) Entfernen Sie die Kontrollläufe aus den Daten, indem Sie sie ausschließen (und eventuell auch ausblenden, aber vielleicht auch nicht, je nachdem, was Sie sehen möchten).
3) Fügen Sie der Datentabelle unterschiedliche Dosierungsstufen Ihrer Kontrolle hinzu.
Ihr Vorgehen hängt von den Informationen ab, die Sie über die Kontrollpartikelgröße im Vergleich zu den anderen Partikelgrößen erhalten möchten.
