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Come creare un grafico del vulcano di espressione genica differenziale utilizzando la differenza media nello screening della risposta

Cari esperti,

Sto cercando di creare un grafico differenziale del vulcano genetico che mostri la differenza media con JMP17.2. Ho utilizzato lo screening delle risposte e ho impostato un controllo utilizzando le informazioni sulla colonna, ma non sono riuscito a trovare dove applicare l'opzione "differenza media". I grafici che ho ottenuto finora hanno solo il logworth FDR in base alla dimensione dell'effetto, a Rsqured o alla pendenza, non sono riuscito a ottenere il logworth FDR in base alla differenza. E anche nella tabella dei risultati non sono riuscito a vedere la "differenza media". Ho seguito JMP Academic: Genomics Research in JMP Pro YouTube, ma non mostrava come fosse stata ottenuta la differenza media.

Qualcuno può farmi sapere come risolvere questo problema? Molte grazie!

Liu

Analisi e modellazione dei dati di base

Ri: Come creare un grafico del vulcano di espressione genica differenziale utilizzando la differenza media nello screening della risposta

Ciao chris,

Grazie mille per l'aiuto! È stato utile. Adesso potrei generare il grafico del vulcano con la differenza di mezzi.