Strani risultati di regressione logistica a 5 parametriCiao,
Ho una grande quantità di dati Luminex, utilizzando un pannello 48plex, in cui ciascuno dei 48 analiti rilevati nei campioni viene calcolato rispetto a una curva standard (quindi 48 curve standard in totale). Ogni colonna nel mio set di dati è un analita diverso. Ciascuna riga corrisponde a uno standard (in una serie di diluizioni 1:4) o a un campione sconosciuto. Ho utilizzato la seguente funzione per adattare i dati utilizzando una regressione logistica a 5 parametri, 48 volte in serie:
Adatta curva(Y( :"[NOME ANALITA]"n),X( [FATTORE DILUIZIONE]),Adatta logistica 5P(Salva formula di previsione inversa),SendToReport(Dispatch( {}, "Logistic 5P", OutlineBox, {Imposta titolo ( "Logistic 5P" )} )));:"Dil Predictor" << Imposta nome("[NOME ANALITA]")
Tieni presente che so molto poco su come utilizzare JMP e l'ho copiato dall'editor di codice dopo che qualcuno mi ha mostrato come adattare i dati una volta. Per eseguire questa operazione, devo nascondere/escludere tutte le righe contenenti valori per i miei campioni sconosciuti e includere/mostrare solo le righe con dati sugli standard.
Generalmente, ottengo curve con r2 > 0,99 che sembrano adattarsi abbastanza bene ai punti standard misurati nei grafici, ma con parsimonia ottengo curve molto strane (vedi immagine). Non sono esperto nell'adattamento delle curve, ma sembra che una curva migliore potrebbe essere adattata attraverso quei punti. Esistono parametri su come JMP adatta le regressioni logistiche a 5 parametri che posso modificare per evitare queste curve spazzatura?
Grazie
Combinazione e pulizia dei datifinestreRi: Strani risultati di regressione logistica a 5 parametriNon mi aspetterei di adattare un modello di curva logistica con 5 parametri quando i dati non presentano tale complessità. Ad esempio, mi aspetto che i dati mostrino entrambi gli asintoti per adattare una curva logistica con un modello a 4 parametri.
Modelli non lineari come questo hanno elevate correlazioni tra le stime dei parametri, quindi possono essere in primo luogo instabili, anche quando i dati mostrano tutte le caratteristiche della forma attesa.
Re: Strani risultati della regressione logistica a 5 parametriCiao, grazie per la risposta! Ho consultato la documentazione, ma non ho ancora trovato quello che cercavo. Il problema non è legato allo script; è che a volte ottengo risultati errati e non sembra esserci un motivo. Mentre consulto la documentazione, sto cercando un set di parametri che posso modificare per un 5PL, dato che qualcosa non funziona con questa analisi.
Ri: Strani risultati di regressione logistica a 5 parametriCiao, grazie per la risposta! La regolazione della vista dell'asse x mi fa sembrare tutto un adattamento pasticciato (vedi immagine).
Ri: Strani risultati di regressione logistica a 5 parametriBenvenuto!
Si prega di leggere il capitolo relativo alla piattaforma Fit Curve nella documentazione di JMP. Ha molte caratteristiche specifiche per aiutare ad analizzare le curve di diluizione del test.
Non hai bisogno di una sceneggiatura. La tabella dati è alta, quindi invece di nascondere ed escludere righe, puoi utilizzare una colonna di dati identificatore nel ruolo Per per l'elaborazione parallela di tutte le coppie di curve.
Ri: Strani risultati di regressione logistica a 5 parametriCIAO,
Sembra che tu abbia dimenticato di trasformare il tuo asse X in LOG. L'adattamento a 5 parametri fa del suo meglio, ma è possibile notare la maggiore mancanza di adattamento per i valori bassi e intermedi.
Migliore,
TS
Re: Strani risultati della regressione logistica a 5 parametriDate le semplici caratteristiche mostrate nei tuoi dati, credo che la causa dei cattivi adattamenti sia che la tua 5PLC sia sovraparametrizzata. Prova ad adattare una curva logistica con meno parametri, diciamo 3 o 4, e verifica se l'adattamento migliora.
