Wie kann ich aus einer Veröffentlichung ein DoE für die Bioassay-Qualifizierung neu erstellen?Hallo zusammen
Ich möchte das folgende DoE für die Qualifizierung und Robustheitsprüfung zellbasierter Bioassays neu erstellen, veröffentlicht von Coffey et al., 2013 (BioProcess International 11(6) Juni 2013).
Ziele der Qualifizierungsstudie: Abschätzung der Assay-Genauigkeit, Zwischenpräzision und Linearität über den normalen Betriebsbereich der Assay-Bedingungen; um die Robustheit der relativen Wirksamkeit und der 4PL-Modellparameter gegenüber kritischen Testparametern zu beurteilen.
DoE: 2(5–2) teilfaktoriell mit 8 replizierten Mittelpunkten:
- 16 Versuchsläufe werden für jeden Analysten in zwei Blöcke mit je acht Bedingungen aufgeteilt
- zwei Analysten führen an zwei Tagen jeweils vier Versuchsbedingungen durch
- zwei Testproben auf jeder Platte, abwechselnde Platzierung unterschiedlicher Konzentrationen auf und über den Platten.
Ich würde mich über jede Unterstützung freuen.
Grundlegende Datenanalyse und ModellierungVersuchsplanungBetreff: Wie kann ich aus einer Veröffentlichung ein DoE für die Bioassay-Qualifizierung neu erstellen?Hallo @AgnieszkaL
Sie können diese Informationen manuell hinzufügen, indem Sie eine Spalte namens „Nominal Potency“ hinzufügen. Für jedes Replikat könnten Sie die Zeile innerhalb der Datentabelle kopieren.
Wenn wir die erste Zeile in der Veröffentlichung als Beispiel nehmen würden, würde dies viermal in der Datentabelle wiederholt werden. Zwei haben eine Nominalwirksamkeit von 141 %, eine bei 200 % und die letzte bei 71 %.
Betreff: Wie kann ich aus einer Veröffentlichung ein DoE für die Bioassay-Qualifizierung neu erstellen?Exzellent! Danke Owen – super nützlich. Ich dachte auch, dass die Mittelpunkte gegenüber dem ersten Entwurf erweitert worden sein müssen. Die verbleibende Frage betrifft die Replikate. Nähere Angaben hierzu finden sich in der Veröffentlichung nicht. Gibt es eine Möglichkeit, diese Informationen möglicherweise nicht als Teil der DoE, sondern lediglich als Teil der Studieninformationen hinzuzufügen? Dies ist erforderlich, um die Studiendatenanalyse wie folgt durchzuführen:
Betreff: Wie kann ich aus einer Veröffentlichung ein DoE für die Bioassay-Qualifizierung neu erstellen?Hallo @AgnieszkaL ,
Ich konnte ein ähnliches Design für die fünf Faktoren replizieren und Day und Analyst einbeziehen. Aufgrund der Randomisierung wird es nicht genau das gleiche wie im Beispiel sein.
Ich bin mir nicht sicher, wie sie die Informationen über die unabhängigen Replikate für jede nominale Potenz aufgenommen haben. Wissen Sie, ob das auch über DoE geschah oder etwas anderes war?
Wie dem auch sei, ich glaube, dass dies ein anfängliches 8-Run-Custom-Design war, das mit 8 zusätzlichen Mittelpunkten erweitert wurde. Zunächst habe ich das Design über das Custom-Design mit den folgenden Faktoren erstellt:
Die folgende Tabelle zeigt, was Sie erhalten. Da Day ein blockierender Faktor war, konnten wir das Design nicht mit Mittelpunkten ergänzen. Ich musste die Designrolle für Day ändern, indem ich auf das Sternchen klickte und es in einen kategorialen Faktor umwandelte:
Gehen Sie danach zu DoE > Augment Design > Geben Sie Y und alle Faktoren als X ein. Fügen Sie dann Mittelpunkte > 8 hinzu und klicken Sie auf Tabelle erstellen, um die folgenden Daten zu erhalten:
Sie können dann -1 auf Niedrig, 0 auf Mittel und +1 auf Hoch ändern.
Lassen Sie mich wissen, ob das hilft!
