JMP 免疫学？你好，
我们正在与一家细胞治疗公司合作开发 T 细胞免疫治疗产品和疫苗。 DOE 在工艺、配方和检测开发方面具有明显的价值。
我们在那里的联系人也认为他们正在组建的免疫学小组可能有价值。他们将从临床试验中生成大量数据，并且除了 Excel 之外没有任何分析工具。
他们希望我们能够展示一个与免疫学人员相关的案例研究演示。在描述他们将获得的数据类型时，他们使用的术语包括：“药代动力学”、“抗体反应”、“临床测定读数”和“测量作用而不是效果。 ”我想我知道这些词的意思，但我不知道知道我将展示什么来证明 JMP 的价值。我感觉他们有临床试验的反应，并随着时间的推移进行跟踪。
有人知道相关的演示数据集吗？
或者，如果这里不适合使用 JMP，请告诉我，这样我就不会浪费时间。
我在下面发布了该公司免疫学科学家的招聘信息的一部分，以防有帮助。
谢谢，
菲尔
免疫学科学家
该团队负责进行临床前和临床
免疫学研究。我们测量抗体和 T 细胞的反应
用于预防或治疗的候选免疫治疗产品
传染病和癌症。免疫学科学家将开发，
实施和解释免疫学测定并监督实验室操作
和管理。具体职责包括：
• 确保抗体和细胞检测已建立且适当
有资格支持我们的候选人或竞争者的人类和动物研究
产品候选者
• 确保所有必需的技术 SOP 均已编写、到位并维护
进行的化验
• 确保受监管的员工接受培训，并且培训记录是最新的。
• 监督实验以测量动物实验的免疫反应
使用 ELISpot、流式细胞术、ELISA 和其他检测进行人体临床试验
内部或外部执行，例如 RNA-seq、TCR 测序、亲和力
测量、表面等离子共振、免疫组织化学
• 确保临床检测按照 GCP 原则进行
• 支持向承包商（例如承包商）转让所需检测的技术
进行毒理学实验
回复：JMP 免疫学？根据他们正在做的事情，可能会出现“切点分析”。 JMP 具有许多用于此类分析的异常值筛选和检测的出色功能。
如果他们正在进行 ELISA 工作，DOE 非常有帮助，而 FDOE 可能是查看响应数据的不错选择。通常，这些实验着眼于吸光度与稀释度，数据看起来可能适合 4p 或 5p 拟合，但渐近线通常有钩子或不一致。
表面等离子体共振，就像 Biacore 一样，可能会发挥作用。这些数据看起来像动力学反应速率。 FDOE 在这里也很棒，因为大多数情况下曲线只是参数化，参数误差是第二个考虑因素。
回复：JMP 免疫学？谢谢， @karenkopeland 。
这真的很有用。这让我想起，我与从事动物营养试验的科学家进行了很多合作，这些试验也是较小的试验，有一些连续的措施和不同的终点。这些正是最有用的工具。再次感谢，
菲尔
回复：JMP 免疫学？我经常在诊断（即某种分析）和临床试验中使用 JMP。 JMP 中需要什么“取决于”试验以及该试验的终点是什么。与制药试验相比，我参与的试验往往规模较小，并且收集的数据不一定适合 JMP Clinical（想想收集了相当基本数据的数百名而不是数千名受试者）。
JMP 擅长的重点项目包括：
1.数据导入（临床数据来自某个地方，通常是excel，但更经常移动到某种在线EDC（电子数据采集）系统，因此导出可以是sas传输、cvs、xml等。
2.数据探索（重新编码、数据文件顶部的分布等）以找到混乱的临床数据（不要使用这些词 - 可能需要进一步监控的临床数据怎么样）。
3. 虚拟加入（和常规加入）。临床数据通常存在于多个数据文件中，例如人口统计文件、治疗文件、实验室结果文件，以及也可能位于单独文件中的分析数据。
4. 他们可能正在寻找的所有基础知识。
回复：JMP 免疫学？我认为“胆固醇堆积”可能是有用的例子。
回复：JMP 免疫学？感谢@Chris_Kirchberg 、 @Byron_JMP 、 @ian_jmp 、 @benfrancis 、 @Jeff_Perkinson和@MikeD_Anderson 。
这一切都非常有帮助。
我需要与客户核对一下。我们有很多关于开发和监测检测的例子，这是我所期望的。但我认为他们真正想要的是一个例子，展示他们在试验中进行检测时如何查看临床数据。我想我们没有此类数据并不奇怪。
再次感谢，
菲尔
回复：JMP 免疫学？这是一篇有趣的论文，我一直想将其用于演示。这是免疫原性测定中的切点分析。它非常好，因为它显示了一堆不同的方法（所有这些方法似乎都可以在 JMP 中实现）。更重要的是，它包含 PDF 中示例的数据...这还可以让您演示 PDF 导入。
回复：JMP 免疫学？你是对的， @ian_jmp ，有很多点击。
回复：JMP 免疫学？FWIW，我使用 Discovery Paper 搜索工具进行“分析”，得到了八次点击。值得一看，如果你还没有的话。
回复：JMP 免疫学？嗨菲尔，
我只能真正谈论药代动力学，但虽然 JMP 可以拟合该领域的方程，但它不能处理（据我所知）：
- 不同给药方案的患者
- 不同采样计划的患者
- 非线性混合效应回归模型，通常需要区分固定效应和随机效应。
如果您听到这三者中的任何一个，那么最好推荐与 SAS 结合使用。
https://community.jmp.com/t5/JMP-Scripts/Nonlinear-Degradation-Mixed-Model/ta-p/21367不是 PK，而是将 SAS PROCNLMIXED 和 JMP 结合在一起的示例。
希望有帮助。
亲切的问候，
本
回复：JMP 免疫学？关于这一点还有一个想法。由于数据来自临床试验......医学审查人员使用什么:)如果他们还没有的话，也许 JMP Clinical 可以提供帮助。
回复：JMP 免疫学？嗨@Phil_Kay ，
从数据的角度来看，这很难。您可以使用细胞计数数据集进行流式细胞计数分析。我有一些 JMP 也可以导入的 .fcs 文件。我还没有完成工作流程来获取所有 .fcs 文件、加入、操作然后准备进行分析。
生物测定可用于非线性/拟合曲线。如果有帮助的话，有一个药代动力学模型拟合曲线选项。
Snee 的 DOE 临床检测示例检测应与 DOE 和分析相关。
其中大部分将是拟合曲线/非线性建模。
剂量反应类型分析也类似。
@Byron_JMP会有一些额外的想法。
