JMP 免疫學?你好,
我們正在與一家細胞治療公司合作開發 T 細胞免疫療法產品和疫苗。 DOE 在製程、配方和檢測開發方面具有明顯的價值。
我們在那裡的聯絡人也認為他們正在組建的免疫學小組可能有價值。他們將從臨床試驗中產生大量數據,並且除了 Excel 之外沒有任何分析工具。
他們希望我們能夠展示一個與免疫學人員相關的案例研究演示。在描述他們將獲得的數據類型時,他們使用的術語包括:「藥物動力學」、「抗體反應」、「臨床測定讀數」和「測量作用而不是效果。 」我想我知道這些詞的意思,但我不知道知道我會展示什麼來證明 JMP 的價值。我感覺他們有臨床試驗的反應,並隨著時間的推移進行追蹤。
有人知道相關的演示資料集嗎?
或者,如果這裡不適合使用 JMP,請告訴我,這樣我就不會浪費時間。
我在下面發布了該公司免疫學科學家的招聘資訊的一部分,以防有幫助。
謝謝,
菲爾
免疫學科學家
該團隊負責進行臨床前和臨床
免疫學研究。我們測量抗體和 T 細胞的反應
用於預防或治療的候選免疫療法產品
傳染病和癌症。免疫學科學家將開發,
實施和解釋免疫學測定並監督實驗室操作
和管理。具體職責包括:
• 確保抗體和細胞檢測已建立且適當
有資格支持我們的候選人或競爭者的人類和動物研究
產品候選者
• 確保所有必需的技術 SOP 均已編寫、到位並維護
進行的化驗
• 確保受監管的員工接受培訓,並且培訓記錄是最新的。
• 監督實驗以測量動物實驗的免疫反應
使用 ELISpot、流式細胞儀、ELISA 和其他檢測進行人體臨床試驗
內部或外部執行,例如 RNA-seq、TCR 定序、親和力
測量、表面等離子共振、免疫組織化學
• 確保臨床檢測依照 GCP 原則進行
• 支援向承包商(例如承包商)轉移所需檢測的技術
進行毒理學實驗
回覆:JMP 免疫學?根據他們正在做的事情,可能會出現「切點分析」。 JMP 具有許多用於此類分析的異常值篩選和檢測的出色功能。
如果他們正在進行 ELISA 工作,DOE 非常有幫助,而 FDOE 可能是查看回應資料的好選擇。通常,這些實驗著眼於吸光度與稀釋度,數據看起來可能適合 4p 或 5p 擬合,但漸近線通常有鉤子或不一致。
表面等離子體共振,就像 Biacore 一樣,可能會發揮作用。這些數據看起來像是動力學反應速率。 FDOE 在這裡也很棒,因為大多數情況下曲線只是參數化,參數誤差是第二個考慮因素。
回覆:JMP 免疫學?謝謝, @karenkopeland 。
這真的很有用。這讓我想起,我與從事動物營養試驗的科學家進行了許多合作,這些試驗也是較小的試驗,有一些連續的措施和不同的終點。這些正是最有用的工具。再次感謝,
菲爾
回覆:JMP 免疫學?我經常在診斷(即某種分析)和臨床試驗中使用 JMP。 JMP 中需要什麼「取決於」試驗以及該試驗的終點是什麼。與製藥試驗相比,我參與的試驗往往規模較小,並且收集的數據不一定適合 JMP Clinical(想想收集了相當基本數據的數百名而不是數千名受試者)。
JMP 擅長的重點項目包括:
1. 資料導入(臨床資料來自某個地方,通常是 excel,但更常轉移到某種線上 EDC(電子資料擷取)系統,因此匯出可以是 sas 傳輸、cvs、xml 等。
2.資料探索(重新編碼、資料檔案頂部的分佈等)以找到混亂的臨床資料(不要使用這些字詞 - 可能需要進一步監控的臨床資料怎麼樣)。
3. 虛擬加入(和常規加入)。臨床數據通常存在於多個數據文件中,例如人口統計文件、治療文件、實驗室結果文件,以及也可能位於單獨文件中的分析數據。
4. 他們可能正在尋找的所有基礎知識。
回覆:JMP 免疫學?我認為「膽固醇堆積」可能是有用的例子。

回覆:JMP 免疫學?感謝@Chris_Kirchberg 、 @Byron_JMP 、 @ian_jmp 、 @benfrancis 、 @Jeff_Perkinson和@MikeD_Anderson 。
這一切都非常有幫助。
我需要與客戶核對一下。我們有很多關於開發和監測檢測的例子,這是我所期望的。但我認為他們真正想要的是一個例子,展示他們在試驗中進行檢測時如何查看臨床數據。我想我們沒有此類數據並不奇怪。
再次感謝,
菲爾
回覆:JMP 免疫學?這是一篇有趣的論文,我一直想將其用於演示。這是免疫原性測定中的切點分析。它非常好,因為它顯示了一堆不同的方法(所有這些方法似乎都可以在 JMP 中實現)。更重要的是,它包含 PDF 中範例的資料...這也可以讓您示範 PDF 匯入。
回覆:JMP 免疫學?你是對的, @ian_jmp ,有很多點擊。

回覆:JMP 免疫學?FWIW,我使用 Discovery Paper 搜尋工具進行「分析」並獲得了八次點擊。值得一看,如果你還沒有的話。
回覆:JMP 免疫學?嗨菲爾,
我只能真正談論藥物動力學,但雖然 JMP 可以擬合該領域的方程,但它不能處理(據我所知):
- 不同給藥方案的患者
- 不同採樣計劃的患者
- 非線性混合效應迴歸模型,通常需要區分固定效應和隨機效應。
如果您聽到這三者中的任何一個,那麼最好建議與 SAS 結合使用。
https://community.jmp.com/t5/JMP-Scripts/Nonlinear-Degradation-Mixed-Model/ta-p/21367不是 PK,而是將 SAS PROCNLMIXED 和 JMP 結合在一起的範例。
希望有幫助。
親切的問候,
本
回覆:JMP 免疫學?關於這一點還有一個想法。由於數據來自臨床試驗......醫學審查人員使用什麼:)如果他們還沒有的話,也許 JMP Clinical 可以提供幫助。
回覆:JMP 免疫學?嗨@Phil_Kay ,
從數據的角度來看,這很難。您可以使用細胞計數資料集進行流式細胞計數分析。我有一些 JMP 也可以匯入的 .fcs 檔案。我還沒有完成工作流程來獲取所有 .fcs 檔案、加入、操作然後準備進行分析。
生物測定可用於非線性/擬合曲線。如果有幫助的話,有一個藥物動力學模型擬合曲線選項。
Snee 的 DOE 臨床檢測範例檢測應與 DOE 和分析相關。
其中大部分將是擬合曲線/非線性建模。
劑量反應類型分析也類似。
@Byron_JMP會有一些額外的想法。