Salut tout le monde,
Cela peut être très basique, mais étant relativement nouveau dans JMP, j'ai eu beaucoup de mal à mettre en place un DOE qui me permettra d'évaluer un certain nombre de facteurs, notamment le numéro de colonne et de ligne (et leur interaction) dans une plaque à 24 puits. . Mon problème était que lorsque j'essayais d'inclure des colonnes et des lignes dans la conception, certaines positions pouvaient apparaître deux fois et d'autres pas du tout. Si j'essayais de créer une conception incluant tous les autres facteurs, puis d'ajouter manuellement des positions au tableau résultant et au modèle, les VIF (c'est-à-dire la colinéarité) étaient parfois très élevés. Cela pourrait également poser un problème pour les analyses à 96 puits, bien que ce soit probablement moins le cas, car les répétitions seraient probablement plus étalées par coïncidence.
Après avoir lutté avec cela pendant un certain temps, j'ai apparemment trouvé une solution qui consiste à inclure des colonnes et des lignes dans la conception en tant que facteurs covariables. Plus précisément, j'ai créé un tableau de données avec toutes les combinaisons de lignes/colonnes et, avec ce tableau, une conception personnalisée sélectionnée et active dans le menu DOE. Cela m'a permis d'inclure des lignes et des colonnes comme facteurs de covariables dans la conception réelle et il semble que la randomisation prenne désormais en compte les positions et minimise la colinéarité dans la table de conception.
Notez que si votre conception implique plusieurs plaques, vous devez copier les 24 combinaisons lignes/colonnes différentes autant de fois que le nombre de plaques que vous souhaitez inclure. Le fichier joint "24_plate-9_runs" contient simplement 9x24 positions que j'ai utilisées comme entrée pour le DOE trouvé dans "24DWP_DOE-example". Ici, j'ai inclus 3 plaques x 3 jours comme « Difficile » et « Très Difficile » pour modifier les facteurs, respectivement, ce qui a abouti à une conception qui me permet d'évaluer au jour le jour, d'une plaque à l'autre et de puits à puits. variation ainsi que tout effet systématique du numéro de colonne ou de ligne. Notez que dans l'exemple ci-joint, j'ai trié manuellement les positions des puits pour me permettre de doser l'enzyme à l'aide d'un manipulateur de liquide.
S'il vous plaît laissez-moi savoir s'il existe un moyen plus simple d'y parvenir ou si, pour une raison quelconque, mon approche est défectueuse en termes de qualité de la conception résultante.
Super, on dirait que ça marche ! Merci pour la contribution 
Johan
Salut
Je suis également relativement nouveau sur DoE et j'ai eu un problème similaire. J'ai trouvé que l'utilisation de la conception D-optimale comme critère d'optimalité (Conception personnalisée (triangle rouge) --> Critère d'optimalité) m'a donné une distribution précise lorsque j'ai ajouté les lignes et les colonnes comme facteurs catégoriels. J'ai parfois dû augmenter le temps de calcul pour assurer la bonne répartition (Design personnalisé (triangle rouge) --> Temps de recherche du design). 60 s suffisaient dans mon cas.
J'espère que ça aide,
Catherine
