在一個最近的文章，我們分享了 JMP Pro 17 擴展了分析基因組學常用資料類型的功能。我們創造了全面的資源，使用 JMP Pro 進行基因組分析，幫助您了解如何應用 JMP Pro 進行此類分析。@湯姆佩德森JMP 生命科學研發團隊的技術作家是主要作者，他分享了他開發這本新書的經驗。
寫這本新書的動機是什麼？
我們先前的 JMP Genomics 軟體的一大特色是提供各種導入引擎以及一系列專用分析工作流程。這些功能使用戶能夠從許多專有格式的文件中匯入數據，然後進行分析。我們希望為使用者提供在 JMP Pro 中進行類似分析所需的知識。在這裡，我們看到 JMP Pro 可以打開一系列矩陣文件，解析其組織，並準備導入。
您在寫這本書時對 JMP Pro 有什麼發現？
JMP Pro 速度很快。曾經在 JMP Genomics 中需要花費數小時進行的分析現在在 JMP Pro 中只需幾分鐘即可完成。 JMP Genomics 依靠 SAS 軟體來完成其「繁重工作」。在長時間的分析過程中，SAS 不會「記住」資料；相反，它會從磁碟讀取數據，然後重複寫入。您的分析取決於電腦讀取和寫入資料的速度。另一方面，JMP Pro 將所有內容保留在記憶體中，因此分析速度要快得多。此外，JMP Pro 功能強大。在版本 17 中，JMP Pro 得到了顯著改進，可以有效、有效地處理基因組學研究中常見的非常大且廣泛的數據集。以下是 JMP Pro 的兩個範例，揭示了數據中的重要線索。火山圖能夠辨識影響特定表型的遺傳變異。致力於作物改良的植物育種家正在使用電腦雜交的水稻植物來預測在田間進行的最佳雜交。
您認為這本書將如何幫助我們的客戶？
這使用 JMP Pro 進行基因組分析本書旨在向使用者展示如何應用典型的基因組資料分析流程（見下圖）。首先向使用者展示如何匯入數據，然後進行數據轉換、品質控制和標準化。接著繼續進行遺傳標記分析，探索資料中的模式和結構，最後進行統計和預測建模。這種方法使用戶能夠發現隱藏在數據中的信息並做出重要的科學發現。我們還包括一組真實的範例研究，並為使用者提供分析資料的逐步指南。
