在一个最近的文章，我们分享了 JMP Pro 17 扩展了分析基因组学常用数据类型的功能。我们创建了全面的资源，使用 JMP Pro 进行基因组分析，帮助您了解如何应用 JMP Pro 进行此类分析。@汤姆佩德森JMP 生命科学研发团队的首席技术作家是主要作者，他分享了他开发这本新书的经验。
写这本新书的动机是什么？
我们之前的 JMP Genomics 软件的一大特色是提供各种导入引擎以及一系列专用分析工作流程。这些功能使用户能够从许多专有格式的文件中导入数据，然后进行分析。我们希望为用户提供在 JMP Pro 中进行类似分析所需的知识。在这里，我们看到 JMP Pro 可以打开一系列矩阵文件，解析其组织，并准备导入。
您在写这本书时对 JMP Pro 有什么发现？
JMP Pro 速度很快。曾经在 JMP Genomics 中需要花费数小时进行的分析现在在 JMP Pro 中只需几分钟即可完成。 JMP Genomics 依靠 SAS 软件来完成其“繁重工作”。在长时间的分析过程中，SAS 不会“记住”数据；相反，它会从磁盘读取数据，然后重复写入。您的分析取决于计算机读取和写入数据的速度。另一方面，JMP Pro 将所有内容保留在内存中，因此分析速度要快得多。此外，JMP Pro 功能强大。在版本 17 中，JMP Pro 得到了显着改进，可以高效、有效地处理基因组学研究中常见的非常大且广泛的数据集。以下是 JMP Pro 的两个示例，揭示了数据中的重要线索。火山图能够识别影响特定表型的遗传变异。致力于作物改良的植物育种家正在使用计算机杂交的水稻植物来预测在田间进行的最佳杂交。
您认为这本书将如何帮助我们的客户？
这使用 JMP Pro 进行基因组分析本书旨在向用户展示如何应用典型的基因组数据分析流程（见下图）。首先向用户展示如何导入数据，然后进行数据转换、质量控制和标准化。然后继续进行遗传标记分析，探索数据中的模式和结构，最后进行统计和预测建模。这种方法使用户能够发现隐藏在数据中的信息并做出重要的科学发现。我们还包括一组真实的示例研究，并为用户提供分析数据的分步指南。
