如何设计包含 3 个水平(零浓度、中浓度、高浓度)的连续因子筛选 DOE?大家好,
我正在尝试为多个连续生物因素设计一个筛选 DOE,我怀疑这些因素与结果(=生存力)之间存在双相关系:我首先期望在达到一定浓度之前存在正相关性,之后我预计会出现负相关性,因为在较高浓度下会产生毒性。在设计经典筛选 DOE 时如何考虑这种双相关联?或者我是否需要选择一个定制设计,以便能够为每个因素包含 3 个水平:(1) 浓度 0 、(2) 高浓度、(3) 中间浓度?
感谢您的帮助。
亲切的问候,
莎拉
实验设计回复:如何设计包含 3 个水平(零、中、高浓度)连续因子的筛选 DOE?嗨@SaraA ,
很高兴这些最初的建议可能对您有用。
如果您计划为 9 个连续因子创建明确筛选设计,建议的“默认”运行规模为 25,这与您允许的实验预算相比非常经济。但您仍然可以添加更多运行,以实现更高精度的系数估计,和/或更轻松地检测二次效应,并使用比较设计平台比较在设计中添加更多运行的好处。
当/如果可能的话,DSD 是一个非常有趣的选择,因为它允许精确的主效应估计(主效应完全无偏,与任何双因素相互作用或二次效应不相关),并且它们还可以识别对响应(因为每个因素使用 3 个水平)。与此处列出的经典筛选设计相比,还有许多其他优点: 最终筛选设计概述
您还可以使用 DSD 进行封闭,例如,如果您想考虑所用不同板的随机变异性,那么这使得 DSD 成为非常有效的筛选设计选择。
即使 DSD 具有非常有趣的设计属性,我也可能不会停在这个阶段,因为您可能需要通过多种方式获得更多信息(并且您有允许的实验预算,可以更深入地研究这些因素):
- 也许您可能必须细化因素范围,以便专注于更狭窄的感兴趣的实验空间?
- DSD 仍然是筛选设计,因此一旦以高置信度确定主要效应,您可能想要确认在第一个筛选阶段可能检测到的其他效应(双因素相互作用、二次效应)?
- 最后,在预测模型的情况下,添加验证运行和/或其他“训练”运行(可能以空间填充方式)可能会很有趣,以便您可以确认和/或完善您的模型?
这完全取决于您的目标、要求和实验预算/限制,以及您可能需要达到对系统的一定了解的精度。
我希望这个补充性的答案能够帮助你,
回复:如何设计包含 3 个水平(零、中、高浓度)连续因子的筛选 DOE?嗨维克多,
非常感谢您的回复,这非常有帮助。
我想要筛选总共 9 个因素,并且最多包含 54 次运行。我对某些组合没有任何限制 - 所有组合在技术上都是可能的。
此前,对于测试不同生物化合物对细胞活力影响的类似实验,我首先使用 Plackett-Burman 设计进行筛选,然后使用全因子设计进行优化。然而,这些设计不允许包括中心点。最终的筛选设计听起来是一个有吸引力的选择。与经典的 Plackett-Burman 设计相比,使用明确的筛选设计有什么缺点吗?通过仅执行一次而不是两次实验设计,最终的筛选设计也可能具有成本效益。还是仍然建议事后进行优化设计?
谢谢你!
莎拉
回复:如何设计包含 3 个水平(零、中、高浓度)连续因子的筛选 DOE?嗨@SaraA ,
欢迎来到社区!
您所描述的情况似乎意味着响应存在一定的曲率。
根据您拥有的独立因素的数量(和类型:仅数值连续?)、约束、可用的实验预算,...我建议尝试:
- Definitive Screening Design ,针对多个连续数值因素的非常强大的筛选设计(建议 5 个以上因素,低于 5 个因素使用它可能不是很经济/高效),对连续因素使用三个水平,可能能够检测到主要因素效应、相互作用和二次效应。但是,您需要检查您的实验空间是否存在不允许某些组合的限制(否则请使用以下设计建议),
- D-最优设计( 定制设计),灵活的设计,您对假设的模型和所包含的条款具有完全的灵活性。例如,如果您希望每个因子具有中间水平,则可以在模型中将二次项包含为“必要”或“如果可能”(取决于您的实验预算和估计二次项的需要/精度)。定制设计还能够考虑各种因素类型(包括混合、分类、协变量……),并且在存在不允许的组合或实验限制的情况下非常有帮助。
两种设计都可以使用阻塞来帮助减少存在已知且可控的干扰因素(时间、不同操作员……)的噪声。您可以创建多个设计并使用比较设计平台对它们进行比较,以更好地评估每种方法/设计的优缺点。
如果您能提供更多关于因素数量、范围、约束(如果存在)、实验预算……的信息,我可能还有其他意见或建议,其他社区成员也可以加入讨论:)
我希望第一个答案可以帮助你
回复:如何设计包含 3 个水平(零、中、高浓度)的连续因子筛选 DOE?根据您提供的信息,您可以采取任何一种方式。仅 2 级设计需要包括一些中心点,以查看系统中是否存在响应中的曲率。所以无论你做什么,这实际上都是一个 3 级设计。最佳设计方法更以模型为中心,因此您可以先定义模型,然后让 JMP 找出最佳设计。无论哪种方式都可以。也许其他考虑因素可能会引导您走上某条道路?
1. 影响系统响应的噪声因素?
2. 整个推理空间的响应有变化吗?我过去的经验表明细胞活力研究可能变化很大?
3. 不允许/不需要的治疗组合?
4. 资源限制,因此设计中的试验次数可能有上限?
回复:如何设计包含 3 个水平(零、中、高浓度)连续因子的筛选 DOE?嗨@Victor_G
当尝试使用 DSD 设计实验时,我看不到可以在哪里添加重复运行?这不是 DSD 的指示吗?
谢谢
莎拉
回复:如何设计包含 3 个水平(零、中、高浓度)的连续因子筛选 DOE?添加因素后,您将看到以下屏幕。您可以添加块。这些是重复的。
