¿Cómo crear un diseño que combine encontrar la mejor combinación de sustancias junto con encontrar su mejor concentración?Estimado equipo JMP,
Estoy planeando un experimento en el que tengo dos categorías de moléculas (categoría A y categoría 
. Ambos tienen dos posibles moléculas candidatas cada uno: categoríaA = {molA1, molA2} y categoríaB = {molB1, molB2}. También me gustaría modelar la concentración de cada molécula como factor independiente.
Primero estaba pensando en agregar dos factores continuos como ConcentrationCategoryA y ConcentrationCategoryB. Aquí viene mi primera pregunta. Tengo diferentes concentraciones altas y bajas para las cuatro moléculas. ¿Es factible usar en los diseños +1 y -1 como de costumbre y luego adaptar la tabla de diseño con los valores reales (pero diferentes), o de alguna manera sesgo el espacio de diseño con esto?
En segundo lugar, se me ocurrió la idea de agregar para cada molécula un factor de concentración continuo, lo que da como resultado 6 factores adicionales. En este caso obtengo diseños en los cuales categoríaA == molA2 y al mismo tiempo molA1 == +1. Pero dado que se ha "elegido" molA2, no tiene ningún sentido codificar molA1. Lo ideal sería que tuviera algún tipo de "-" o NA. ¿Cómo puedo construir esto y aún tener un diseño sólido?
Debido a limitaciones de tiempo y dispositivo, solo tengo una ejecución con un máximo de 48 experimentos. Los próximos pasos serán la validación en una configuración a mayor escala.
Muchas gracias por tu ayuda,
Tomás
Diseño de experimentosRe: ¿Cómo crear un diseño que combine encontrar la mejor combinación de sustancias y encontrar su mejor concentración?Bienvenido a la comunidad. No entiendo su situación, pero aquí están mis pensamientos/preguntas:
¿Está interesado en comprender la estructura causal o está tratando de "elegir un ganador"?
Estoy un poco confundido, ¿son independientes los factores de las 2 categorías de moléculas? ¿Ambos serán parte del producto final o elegirás entre A y B? ¿Le importa una posible interacción entre A y B? ¿O son parte de una mezcla (en cuyo caso es posible que desee utilizar un diseño de mezcla)?
¿Qué modelo estás investigando?
Una interpretación: tiene 3 factores, X1 es la categoría de molécula con 2 niveles, A y B (¿Estoy en lo cierto al suponer que el factor 1 es un factor categórico?). X2 es candidato (no puedo decir si es categórico o continuo), ¿puede estar anidado? X3 es Concentración cuyos niveles dependen de los niveles de X1 y es continua (esto definitivamente está anidado). Con el anidamiento, se pueden determinar los efectos de cada factor, pero no los efectos de la interacción.
Y = X1 + X2[X1] + X3[X1, X2]
Otra interpretación: tienes 2 factores, X1 es la categoría de molécula y tiene 4 niveles. X2 es continuo y los niveles de X2 dependen de X1, por lo que está anidado.
Y = X1 + X2[X1]
Otro, si la categoría de molécula es independiente:
Y = X1 + X2 + X1X2 + X3 [X1, X3]
Re: ¿Cómo crear un diseño que combine encontrar la mejor combinación de sustancias y encontrar su mejor concentración?Querido estadístico,
Gracias por su rápida respuesta. Déjame aclarar más.
Mi objetivo es elegir la mejor combinación de dos moléculas, cada una de las cuales se dirige a una vía biológica diferente. Al mismo tiempo, quiero conocer la relación entre las vías (efectos sinérgicos y antagónicos) y, en última instancia, también poder decir qué combinación de 2 moléculas y qué concentración es mejor para las dos. Incluso me gustaría proponer un cambio de concentración de la tupla ganadora, comprobando los coeficientes de concentración.
Mi modelo:
Tengo 4 factores. X1 es el candidato de la vía 1 con 2 niveles (A&B), X2 es el candidato de la vía 2 con dos niveles (C&D), X3 es la concentración del candidato de la vía 1 cuyos niveles dependen de los niveles de X1 y X4 es la concentración del candidato de vía 2, cuyos niveles dependen de X2. A, B, C y D se dan en concentraciones totalmente diferentes, lo que crea mi principal motivo de preocupación. ¿Podría simplemente codificar X1 y X4 con (-1 y +1) e insertar manualmente las concentraciones reales más tarde, incluso si son diferentes condicionalmente por X1 y X2, respectivamente?
Mientras tanto encontré este hilo muy relacionado: https://community.jmp.com/t5/Discussions/Nested-DOE-with-continous-factors/td-p/674509 , solo que tengo esto tres veces. ¿Qué recomendarías ahora, porque no entendí completamente cómo se resolvió finalmente este hilo? Tampoco pude descubrir cómo crear un diseño anidado con el diseñador personalizado.
Gracias,
Tomás
