Come creare un design che combini la ricerca della migliore combinazione di sostanze con la ricerca della loro migliore concentrazione?Caro team JMP,
Sto pianificando un esperimento in cui ho due categorie di molecole (categoria A e categoria 
. Entrambi hanno due possibili molecole candidate ciascuno: categoria A = {molA1, molA2} e categoria B = {molB1, molB2}. Vorrei anche modellare la concentrazione di ciascuna molecola come fattore indipendente.
Inizialmente stavo pensando di aggiungere due fattori continui come ConcentrationCategoryA e ConcentrationCategoryB. Ecco la mia prima domanda. Ho diverse concentrazioni alte e basse per le quattro molecole. È possibile utilizzare semplicemente nei progetti +1 e -1 come al solito e subito dopo adattare la tabella di progettazione con i valori reali (ma diversi), o in qualche modo distorco lo spazio di progettazione con questo.
In secondo luogo mi è venuta l'idea di aggiungere per ogni molecola un fattore di concentrazione continuo, ottenendo 6 fattori aggiuntivi. In questo caso ottengo disegni in cui categoriaA == molA2 e contemporaneamente molA1 == +1. Ma poiché molA2 è stata "scelta" non ha alcun senso codificare per molA1. Idealmente dovrebbe avere una sorta di "-" o NA. Come posso costruirlo e avere comunque un design solido?
A causa di vincoli di tempo e dispositivo, ho solo una sessione con un massimo di 48 esperimenti. I prossimi passi saranno la convalida in un contesto su scala più ampia
Grazie mille per il vostro aiuto,
Tom
Progettazione di esperimentiRe: Come creare un design che combini la ricerca della migliore combinazione di sostanze con la ricerca della loro migliore concentrazione?Benvenuto nella comunità. Non capisco la tua situazione, ma ecco i miei pensieri/domande:
Sei interessato a comprendere la struttura causale o stai cercando di "scegliere un vincitore"?
Sono un po' confuso, i fattori delle 2 categorie molecolari sono indipendenti? Entrambi faranno parte del prodotto finale o sceglierai tra A e B? Ti interessa una possibile interazione tra A e B? Oppure fanno parte di una miscela (nel qual caso potresti voler utilizzare un design misto)?
Che modello stai studiando?
Un'interpretazione: hai 3 fattori, X1 è la categoria molecolare con 2 livelli, A e B (ho ragione nel presupporre che il fattore 1 sia un fattore categorico?). X2 è Candidato (non riesco a capire se è categorico o continuo), potrebbe essere nidificato? X3 è Concentrazione i cui livelli dipendono dai livelli di X1 ed è continua (questo è sicuramente nidificato). Con la nidificazione è possibile determinare gli effetti di ciascun fattore, ma non gli effetti dell'interazione.
Y = X1 + X2[X1] + X3[X1, X2]
Un'altra interpretazione: hai 2 fattori, X1 è la categoria delle molecole e ha 4 livelli. X2 è continuo e i livelli X2 dipendono da X1 quindi è annidato.
Y = X1 + X2[X1]
Un altro, se la categoria della molecola è indipendente:
Y = X1 + X2 + X1X2 + X3 [X1, X3]
Re: Come creare un design che combini la ricerca della migliore combinazione di sostanze con la ricerca della loro migliore concentrazione?Caro statista,
grazie per la risposta veloce Vorrei chiarire ulteriormente.
Il mio obiettivo è scegliere la migliore combinazione di due molecole, ciascuna delle quali mira a un percorso biologico diverso. Allo stesso tempo voglio scoprire la relazione tra i percorsi (effetti sinergici, antagonisti) e infine anche essere in grado di dire quale combinazione di 2 molecole e quale concentrazione per le due è la migliore. Vorrei anche proporre un cambiamento nella concentrazione della tupla vincente, controllando i coefficienti della concentrazione.
Il mio modello:
Ho 4 fattori. X1 è il candidato del percorso 1 con 2 livelli (A&B), X2 è il candidato del percorso 2 con due livelli (C&D), X3 è la concentrazione del candidato del percorso 1 i cui livelli dipendono dai livelli di X1 e X4 è la concentrazione del candidato di percorso 2, i cui livelli dipendono da X2. A, B, C e D sono forniti in concentrazioni totali diverse, il che crea il mio principale motivo di preoccupazione. Potrei semplicemente codificare X1 e X4 con (-1 e +1) e inserire manualmente le concentrazioni effettive in un secondo momento, anche se sono diverse condizionatamente da X1 e X2, rispettivamente.
Nel frattempo ho trovato questo thread molto correlato: https://community.jmp.com/t5/Discussions/Nested-DOE-with-continous-factors/td-p/674509 , solo che l'ho fatto tre volte. Cosa consiglieresti ora, perché non ho capito appieno come è stato risolto alla fine questo thread. Inoltre, non sono riuscito a scoprire come creare un disegno annidato con il designer personalizzato.
Grazie,
Tom
