Wie kann ein Design erstellt werden, das die Suche nach der besten Kombination von Substanzen mit der Suche nach ihrer besten Konzentration verbindet?Liebes JMP-Team,
Ich plane ein Experiment, bei dem ich zwei Kategorien von Molekülen habe (Kategorie A und Kategorie 
. Beide haben jeweils zwei mögliche Molekülkandidaten: KategorieA = {molA1, molA2} und KategorieB = {molB1, molB2}. Ich möchte auch die Konzentration jedes Moleküls als unabhängigen Faktor modellieren.
Ich dachte zuerst darüber nach, zwei kontinuierliche Faktoren wie ConcentrationCategoryA und ConcentrationCategoryB hinzuzufügen. Hier kommt meine erste Frage. Ich habe für die vier Moleküle unterschiedliche hohe und niedrige Konzentrationen. Ist es machbar, in den Designs einfach +1 und -1 wie gewohnt zu verwenden und die Designtabelle später einfach an die realen (aber unterschiedlichen) Werte anzupassen, oder verzerre ich damit irgendwie den Designraum?
Zweitens kam ich auf die Idee, für jedes Molekül einen kontinuierlichen Konzentrationsfaktor hinzuzufügen, was zu 6 zusätzlichen Faktoren führte. In diesem Fall erhalte ich Designs, bei denen KategorieA == molA2 und gleichzeitig molA1 == +1. Aber da molA2 „ausgewählt“ wurde, macht es überhaupt keinen Sinn, für molA1 zu kodieren. Idealerweise hätte es eine Art „-“ oder NA. Wie kann ich das bauen und trotzdem ein solides Design haben?
Aus Zeit- und Gerätegründen habe ich nur einen Durchlauf mit maximal 48 Experimenten. Die nächsten Schritte werden die Validierung in einem größeren Maßstab sein
Vielen Dank für Ihre Hilfe,
Tom
VersuchsplanungBetreff: Wie erstellt man ein Design, das die Suche nach der besten Stoffkombination mit der Suche nach der besten Konzentration verbindet?Willkommen in der Community. Ich verstehe Ihre Situation nicht, aber hier sind meine Gedanken/Fragen:
Sind Sie daran interessiert, die kausale Struktur zu verstehen oder versuchen Sie, einen „Gewinner“ auszuwählen?
Ich bin etwas verwirrt. Sind die beiden Faktoren der Molekülkategorie unabhängig? Werden beide Teil des Endprodukts sein, oder entscheiden Sie sich zwischen A und B? Interessieren Sie sich für eine mögliche Interaktion zwischen A und B? Oder sind diese Teil einer Mischung (in diesem Fall möchten Sie möglicherweise ein Mischungsdesign verwenden)?
Welches Modell untersuchen Sie?
Eine Interpretation: Sie haben drei Faktoren. X2 ist Kandidat (kann nicht sagen, ob dies kategorisch oder kontinuierlich ist), ist dies möglicherweise verschachtelt? X3 ist eine Konzentration, deren Niveaus von den Niveaus von X1 abhängen und kontinuierlich ist (dies ist definitiv verschachtelt). Durch die Verschachtelung können Sie die Auswirkungen jedes Faktors bestimmen, nicht jedoch die Interaktionseffekte.
Y = X1 + X2[X1] + X3[X1, X2]
Eine andere Interpretation: Sie haben zwei Faktoren, X1 ist die Molekülkategorie und sie hat 4 Ebenen. X2 ist kontinuierlich und die Ebenen von X2 hängen von X1 ab, sodass es verschachtelt ist.
Y = X1 + X2[X1]
Eine andere, wenn die Molekülkategorie unabhängig ist:
Y = X1 + X2 + X1X2 + X3 [X1, X3]
Betreff: Wie erstellt man ein Design, das die Suche nach der besten Stoffkombination mit der Suche nach der besten Konzentration verbindet?Lieber Statmann,
Danke für die schnelle Antwort. Lassen Sie mich das näher erläutern.
Mein Ziel ist es, die beste Kombination aus zwei Molekülen auszuwählen, die jeweils auf einen anderen biologischen Weg abzielen. Gleichzeitig möchte ich die Zusammenhänge zwischen den Signalwegen (synergistische, antagonistische Effekte) herausfinden und letztendlich auch sagen können, welche Kombination aus zwei Molekülen und welche Konzentration für beide am besten ist. Ich würde sogar gerne eine Änderung der Konzentration des Gewinnertupels vorschlagen, indem ich die Koeffizienten der Konzentration überprüfe.
Mein Modell:
Ich habe 4 Faktoren. X1 ist ein Kandidat aus Pfad 1 mit zwei Ebenen (A&B), X2 ist ein Kandidat aus Pfad 2 mit zwei Ebenen (C&D), X3 ist die Konzentration des Kandidaten aus Pfad 1, deren Ebenen von den Ebenen von X1 abhängen, und X4 ist die Konzentration des Kandidaten von Signalweg 2, dessen Niveaus von X2 abhängen. A, B, C und D werden in völlig unterschiedlichen Konzentrationen verabreicht, was mir größte Sorge bereitet. Könnte ich einfach X1 und
In der Zwischenzeit fand ich diesen Thread sehr verwandt: https://community.jmp.com/t5/Discussions/Nested-DOE-with-continous-factors/td-p/674509 , nur dass ich das dreimal habe. Was würden Sie jetzt empfehlen, da ich nicht ganz verstanden habe, wie dieser Thread letztendlich gelöst wurde? Ich konnte auch nicht herausfinden, wie man mit dem benutzerdefinierten Designer ein verschachteltes Design erstellt.
Danke,
Tom
