A proposito di MAQC
I microarray e il sequenziamento di nuova generazione rappresentano le tecnologie fondamentali nella farmacogenomica e nella tossicogenomica; tuttavia, prima che queste tecnologie possano essere utilizzate con successo e affidabilità nella pratica clinica e nel processo decisionale normativo, è necessario sviluppare standard e misure di qualità. Il progetto MAQC sta contribuendo a migliorare le tecnologie di microarray e di sequenziamento di prossima generazione e a promuovere le loro corrette applicazioni nella scoperta, nello sviluppo e nella revisione di prodotti regolamentati dalla FDA. Tutti sono invitati a partecipare al progetto MAQC.
Lo sforzo del consorzio a livello comunitario guidato dalla FDA è quello di affrontare le questioni relative all'applicazione di tecnologie genomiche ad alto rendimento in costante evoluzione per valutare la sicurezza e l'efficacia dei prodotti regolamentati dalla FDA o il loro uso sicuro ed efficace nelle applicazioni cliniche come dispositivi diagnostici in vitro. Il consorzio MAQC ha completato tre progetti tra il 2005 e il 2014 (denominati MAQC I, II e III), risultando in circa 30 pubblicazioni, di cui un terzo pubblicato su Nature Biotechnology. Inoltre, due di questi articoli sono stati tra i più citati in Nature Biotechnology negli ultimi 20 anni.
Maggiori informazioni sono qui
L'elenco delle pubblicazioni risultanti dal progetto MAQC è qui
Cosa è disponibile nella Libreria di riferimento tecnico
Cosa c'è di buono in questo
- Questi sono esempi di dati estesi e saranno utili per mostrare la maggiore capacità di JMP di analizzare i problemi relativi ai dati estesi
- I dati sono reali e producono scoperte significative.Ad esempio, utilizzando i dati sul cancro al seno, eseguire un PCA, salvare i primi 10 componenti principali e utilizzarli con GenReg per prevedere lo stato del recettore degli estrogeni.Ottengo un valore R-quadrato del 75%.
- Il progetto è stato molto produttivo generando oltre 30 pubblicazioni (vedi link sopra).T Due di questi articoli sono stati tra i più citati in Nature Biotechnology negli ultimi 20 anni.Tra i contributori figura il nostro Russ Wolfinger (e Kelci Miclaus).
- Lo studio ha avuto 4 fasi e i dati caricati nella libreria provengono dalla fase 2, MAQC-II.La fase 2 ha utilizzato microarray che presentano somiglianze con i chip semiconduttori.Sebbene i risultati (la ricerca sul cancro) siano biologici, il metodo avrà risonanza con quelli del settore dei semiconduttori, che ha anche ampi problemi di dati.
