JMP를 사용하여 생물학적 분석에 사용할 수 있는 모든 플레이트 레이아웃을 만들고 싶습니다.
1. 플레이트에 4개의 열과 4개의 행이 있고 8개의 샘플이 플레이트에 복제되어 있는 경우(아래 예시 참조)
2. 플레이트에 4열, 6행이 있고 12개의 샘플이 플레이트에 복제되어 있는 경우
JMP DoE 플랫폼을 사용하면 이것이 가능합니까?
8개의 중복된 샘플이 있는 4x4 플레이트에 대한 레이아웃 예:
안녕 @Fiona_Baines ,
"Custom DoE" 플랫폼을 사용하면 주요 디자인을 매우 쉽게 생성할 수 있다고 생각합니다.
- 2개의 범주형 요인 "Col" 및 "Row"를 4개 수준으로 지정합니다.
- 주효과와 2요인 상호작용이 있는 모형을 지정합니다. 그래프에서와 같이 각 위치 지점에 대해 하나의 실험을 수행하기 위해 최소 실행 수(16)를 선택할 수 있습니다. 그렇지 않으면 권장되는 기본 숫자 32는 각 위치에 대해 2개의 실행을 제공합니다.
16회 실행 DoE의 예:
다음은 최소 실행 수 DOE를 얻는 스크립트입니다.
DOE(
Custom Design,
{Add Response( Maximize, "Y", ., ., . ),
Add Factor( Categorical, {"1", "2", "3", "4"}, "Row", 0 ),
Add Factor( Categorical, {"A", "B", "C", "D"}, "Col", 0 ),
Set Random Seed( 1171712789 ), Number of Starts( 1 ), Add Term( {1, 0} ),
Add Term( {1, 1} ), Add Term( {2, 1} ), Add Term( {1, 1}, {2, 1} ),
Set Sample Size( 16 ), Simulate Responses( 0 ), Save X Matrix( 0 ), Make Design,
Set Run Order( Randomize ), Make Table}
)
두 번의 반복 실험 상황과 관련하여 사용자 정의 설계 플랫폼에서 원하는 실행 수를 지정할 수 있습니다(최소 요구 수 이상, 귀하의 경우 16이므로 24 실행 설계(8 반복 실행 포함)를 생성할 수 있습니다). 32개 실행 설계(12개 반복 실행 포함)이지만 이러한 반복 실행이 배포되는 위치에 영향을 미칠 가능성이 없을 수도 있습니다.
8개의 중복 실행이 있는 예:
또 다른 옵션은 최소 실행 횟수(16)로 설계를 생성한 다음 중복하려는 실험을 데이터 테이블에 수동으로 추가(복사하여 붙여넣기)하는 것입니다.
그래프에서 중복된 실행이 어디에 있는지 시각화/이해할 수 있는지 잘 모르겠습니다. 실행을 더 쉽게 식별할 수 있도록 마커를 변경할 수 있습니까?
이 답변이 도움이 되길 바라며,
안녕 @Victor_G
내 게시물에 답해 주셔서 감사합니다.
중복은 각 샘플이 각 플레이트에 두 번 표시된다는 사실에서 비롯됩니다. 아래 그래프에서는 상황을 더욱 명확하게 하기 위해 다양한 기호를 사용했습니다. 가능한 모든 플레이트 레이아웃이 포함된 데이터 테이블을 생성하는 방법을 알아내려고 노력하고 있습니다(아래에는 4개의 고유한 플레이트 레이아웃이 설명되어 있습니다).
오해해서 미안해요 @Fiona_Baines , 이제 귀하의 사용 사례를 더 잘 이해한 것 같습니다.
DOE에 이 설정을 사용하면 다음과 같습니다(모델의 주효과만 사용).
그리고 최적성 기준을 Alias-Optimal로 지정하여 설계 검색 시간과 무작위 시작 횟수를 늘려(원하는 설계로 수렴) 기대하는 설계를 얻을 수 있습니다.
재현하려는 스크립트는 다음과 같습니다.
DOE(
Custom Design,
{Add Response( Maximize, "Y", ., ., . ),
Add Factor(
Categorical,
{"S1", "S2", "S3", "S4", "S5", "S6", "S7", "S8"},
"Treatment",
0
), Add Factor( Categorical, {"1", "2", "3", "4"}, "Row", 0 ),
Add Factor( Categorical, {"A", "B", "C", "D"}, "Col", 0 ),
Add Factor( Categorical, {"1", "2", "3", "4"}, "Blocking", 0 ),
Set Random Seed( 1635750691 ), Number of Starts( 77 ), Add Term( {1, 0} ),
Add Term( {1, 1} ), Add Term( {2, 1} ), Add Term( {3, 1} ), Add Term( {4, 1} ),
Add Alias Term( {1, 1}, {2, 1} ), Add Alias Term( {1, 1}, {3, 1} ),
Add Alias Term( {1, 1}, {4, 1} ), Add Alias Term( {2, 1}, {3, 1} ),
Add Alias Term( {2, 1}, {4, 1} ), Add Alias Term( {3, 1}, {4, 1} ),
Set Sample Size( 64 ), Optimality Criterion( "Make Alias Optimal Design" ),
Simulate Responses( 0 ), Save X Matrix( 0 ), Make Design,
Set Run Order( Randomize within Blocks ), Make Table}
)
그리고 그래프 스크립트로 데이터 테이블을 첨부했습니다.
이 디자인을 수행하는 더 간단하고 쉬운 방법이 있을 수 있지만 이 옵션은 여전히 도움이 될 수 있습니다.
이 디자인은 여러분의 기대에 더 잘 맞을 것입니다 
