Vorrei utilizzare JMP per creare tutti i possibili layout delle piastre per un test biologico:
1. dove la piastra ha 4 colonne e 4 file e 8 campioni sono duplicati sulla piastra (esempio illustrato di seguito)
2. dove la piastra ha 4 colonne e 6 file e 12 campioni sono duplicati sulla piastra
Ciò è possibile utilizzando la piattaforma JMP DoE?
un layout di esempio per una piastra 4x4 con 8 campioni duplicati:
CIAO @Fiona_Baines ,
Penso che il tuo progetto principale potrebbe essere generato molto facilmente con la piattaforma "Custom DoE":
- Specifica i tuoi 2 fattori categorici "Col" e "Riga" con 4 livelli:
- Specificare un modello con effetti principali e interazione a 2 fattori. Puoi scegliere il numero minimo di esecuzioni (16) per avere un esperimento per ciascuno dei punti di posizione come nel grafico, altrimenti il numero predefinito consigliato 32 fornirà 2 esecuzioni per ciascuna posizione.
Esempio con il DoE da 16 esecuzioni:
Ecco lo script per ottenere il numero minimo di esecuzioni DOE:
DOE(
Custom Design,
{Add Response( Maximize, "Y", ., ., . ),
Add Factor( Categorical, {"1", "2", "3", "4"}, "Row", 0 ),
Add Factor( Categorical, {"A", "B", "C", "D"}, "Col", 0 ),
Set Random Seed( 1171712789 ), Number of Starts( 1 ), Add Term( {1, 0} ),
Add Term( {1, 1} ), Add Term( {2, 1} ), Add Term( {1, 1}, {2, 1} ),
Set Sample Size( 16 ), Simulate Responses( 0 ), Save X Matrix( 0 ), Make Design,
Set Run Order( Randomize ), Make Table}
)
Per quanto riguarda la situazione con due repliche, puoi specificare nella piattaforma di progettazione personalizzata il numero di esecuzioni che desideri (superiore o uguale al numero minimo richiesto, nel tuo caso 16, in modo da poter creare un disegno a 24 esecuzioni (con 8 esecuzioni replicate) o un progetto da 32 esecuzioni (con 12 esecuzioni replicate), ma potresti non avere la possibilità di influenzare dove verranno distribuite queste esecuzioni replicate.
Esempio con 8 esecuzioni duplicate:
Un'altra opzione è generare il progetto con il numero minimo di esecuzioni (16), quindi aggiungere manualmente (copia-incolla) sul datatable gli esperimenti che si desidera in duplicato.
Nel tuo grafico, non sono proprio sicuro di visualizzare/capire dove sono le corse duplicate. Potresti cambiare il marcatore per identificare più facilmente le piste?
Spero che questa risposta ti possa aiutare,
CIAO @Victor_G
Molte grazie per aver risposto al mio post.
La duplicazione deriva dal fatto che ciascun campione apparirà su ciascuna piastra due volte. Ho utilizzato diversi simboli nel grafico sottostante per cercare di rendere le cose più ovvie. Sto cercando di capire come generare una tabella dati che contenga tutti i possibili layout di piastra (di seguito sono illustrati quattro layout di piastra unici).
Scusa per il mio malinteso @Fiona_Baines , Penso di capire meglio ora il tuo caso d'uso.
Utilizzando questa configurazione per il DOE (e utilizzando solo gli effetti principali nel modello):
E specificando il criterio di ottimalità come Alias-Optimal, aumentando il tempo di ricerca del progetto e il numero di avvii casuali (per convergere verso il progetto desiderato), sono in grado di avere il progetto che ti aspetti:
Ecco lo script se vuoi riprodurlo:
DOE(
Custom Design,
{Add Response( Maximize, "Y", ., ., . ),
Add Factor(
Categorical,
{"S1", "S2", "S3", "S4", "S5", "S6", "S7", "S8"},
"Treatment",
0
), Add Factor( Categorical, {"1", "2", "3", "4"}, "Row", 0 ),
Add Factor( Categorical, {"A", "B", "C", "D"}, "Col", 0 ),
Add Factor( Categorical, {"1", "2", "3", "4"}, "Blocking", 0 ),
Set Random Seed( 1635750691 ), Number of Starts( 77 ), Add Term( {1, 0} ),
Add Term( {1, 1} ), Add Term( {2, 1} ), Add Term( {3, 1} ), Add Term( {4, 1} ),
Add Alias Term( {1, 1}, {2, 1} ), Add Alias Term( {1, 1}, {3, 1} ),
Add Alias Term( {1, 1}, {4, 1} ), Add Alias Term( {2, 1}, {3, 1} ),
Add Alias Term( {2, 1}, {4, 1} ), Add Alias Term( {3, 1}, {4, 1} ),
Set Sample Size( 64 ), Optimality Criterion( "Make Alias Optimal Design" ),
Simulate Responses( 0 ), Save X Matrix( 0 ), Make Design,
Set Run Order( Randomize within Blocks ), Make Table}
)
E ha allegato il datatable con lo script grafico.
Potrebbe esserci un modo più semplice e diretto per eseguire questo progetto, ma questa opzione può comunque essere utile.
Questo design dovrebbe adattarsi meglio alle tue aspettative 
