係数を使用したカウントデータの適切な分析2 つの異なる種類の植物 (A と 
から菌類を培養する実験があります。私はすべての種を種ごとに識別しました。2 つの植物タイプ間で菌類種が回収された回数に統計的な違いがあるかどうかをテストしたいと考えています。私は JMP 17 を使用しており、植物の種類と種、およびそれらの相互作用を固定因子として扱う一般化線形モデルが機能すると考えていましたが、エラー メッセージが表示され続けます。何か案は？分析を行う別の方法はありますか?
基本的なデータ分析とモデリングRe: 因子を含むカウントデータの適切な分析エラーメッセージは何ですか? データ収集はどのように設計しましたか? 植物の種類と種はたった 2 つの要素ですか? 線形モデルに相互作用項を作成するためにこれらを掛け合わせましたか?
植物タイプ = {A, B} および種 = {1, 2, 3} のように、植物タイプと種が独立していない限り、交互作用項を推定することはできません。 両方の種類の植物に同じ種を含めることはできますか?
Re: 因子を含むカウントデータの適切な分析植物の種類と種を因子として実験をシミュレートしました。 ポアソン分布を使用して応答をシミュレートしました。 調べられるようにデータ表を添付しました。
GLM を交互作用項で定義しました。
デフォルトの分析レポートを取得しました。
Re: 因子を含むカウントデータの適切な分析ありがとう、検討してみます。植物は同じ畑にある 2 つの異なる種で、それぞれ 25 株あります。次に、葉をサンプリングし、葉に存在する菌類を培養して除去しました。いくつかの真菌種は、ある種に存在し、別の種に存在しないこともあれば、両方に存在することもあります。私が評価したいのは、真菌が分離された回数 (カウント) です。基本的に、植物 A に多かれ少なかれ種 X が見られるでしょうか。
種ごとまたは植物ごとに回収された分離株または種の数を制御できなかったという事実は、データセット全体にゼロとアンバランスがあることを意味します。おそらくそれがエラーの原因なのでしょうか？
Re: 因子を含むカウントデータの適切な分析反応は菌類種の有無であると考えて、その菌類が存在する植物 (25 株中) の数を数えますか?
GLM 解析ではポアソン分布を使用しないことが最善です。 それぞれの数がわかっているため、二項モデル (不在、存在) を使用します。 つまり、y はカビありの数、25-y はカビなしの数です。
データテーブルは次のようになります。
最後の列にカウントを入力します。 「分析」>「モデルの適合」を選択するアクションを完了するためのテーブル スクリプトを保存しました。 起動ダイアログは次のようになります。
データ表が添付されています。
Re: 因子を含むカウントデータの適切な分析アイデアをありがとう。ほぼ間違いないと思いますが、私が持っているのは基本的に 20 種の菌類のリストです。ほとんどは、さまざまな種類の植物からさまざまな量で分離されるため、植物 a には 20 の種が存在する可能性がありますが、植物 b には 45 の種が存在する可能性があります。私は、特定の種が異なる植物間で異なるかどうかを、ある程度の自信を持って言えるようになりたいと考えています。
Y by X 分析のカテゴリ変数として植物ごとに菌類の種を分析する場合、従来のカイ 2 乗が機能すると思いましたが、どのようにして正確な種の違いを判断できるかわかりません。私が解釈すると、カイ二乗が重要であるということは、植物 a と b の間の分布がすべての種にわたって異なることを示すだけであり、植物 a と b でどの菌種が異なるかということではありません。
Re: 因子を含むカウントデータの適切な分析植物種と菌類種の組み合わせがある場合、クロス集計が機能するはずです。
違うのか、違うのか、どっちですか？ 仮説検定は、証拠の強度 (サンプル統計量の p 値や信頼区間など) に基づいて帰無仮説を棄却するという一方向にのみ機能します。 作業仮説 (代替) と帰無仮説 (自分の仮説ではない) を指定する必要があります。
