JMP > 多元分析 > 相關性> 如何處理大型資料集?JMP 社群您好,
我需要評估基線時在 150 名患者中測量的約 10,500 種生物標記之間的相關性。 我嘗試了一個基於 Y by X 擬合和多元關聯平台的簡單 JSL 腳本。 這兩種方法都需要在我的電腦(Windows 10 Pro、Intel i-7 2.50 GHz、32 GB RAM、JMP 16)上計算很長時間。 是否有更快的方法來產生和檢索 Pearson 的 r 和相關 p 值?值得注意的是,雖然基於矩陣的方法似乎很有吸引力,但它似乎不會返回 p 值。
我感謝您的幫助。
最好的,
TS
自動化和腳本編寫視窗回覆:JMP > 多元分析 > 相關性 > 如何處理大型資料集?是的! 我打開了啟動時的 p 值表選項,所以也許這就是我使用大量記憶體的原因。
回覆:JMP > 多元分析 > 相關性 > 如何處理大型資料集?@蒂埃里_S ,
我有一個資料集,包含 18856 個 mRNA 相對豐度和 65 個樣本。 JMP Pro 16 中的回應篩選似乎需要 120 GB 記憶體(我只有 64 GB,因此正在發生快取)。 現在我提到它可能不是一個好主意。
更新:我將其減少到大約 9000,並且只花了不到一分鐘。 因此,您能夠使用的生物標記物的數量肯定存在一個閾值。
回覆:JMP > 多元分析 > 相關性 > 如何處理大型資料集?你好@克里斯_基希伯格,
美麗的。 處理時間縮短了 5 至 10 倍。
最好的,
TS
回覆:JMP > 多元分析 > 相關性 > 如何處理大型資料集?嗨克里斯,
我沒有想到這種方法。 讓我盡快嘗試。
謝謝,
TS
回覆:JMP > 多元分析 > 相關性 > 如何處理大型資料集?@蒂埃里_S ,
現在需要多長時間? 您是否將其與反應篩選進行比較? 將所有生物標記放入 Y 和 X 中並使用 Corr(皮爾遜積矩相關)高級選項?