À propos du MAQC
Les puces à ADN et le séquençage de nouvelle génération représentent des technologies de base en pharmacogénomique et toxicogénomique ; cependant, avant que ces technologies puissent être utilisées avec succès et de manière fiable dans la pratique clinique et dans la prise de décision réglementaire, des normes et des mesures de qualité doivent être élaborées. Le projet MAQC contribue à améliorer les technologies de micropuces et de séquençage de nouvelle génération et à favoriser leurs applications appropriées dans la découverte, le développement et l'examen de produits réglementés par la FDA. Tout le monde est invité à participer au projet MAQC.
Il s'agit d'un effort de consortium à l'échelle communautaire dirigé par la FDA visant à résoudre les problèmes liés à l'application de technologies génomiques à haut débit en constante évolution, soit pour évaluer la sécurité et l'efficacité des produits réglementés par la FDA, soit pour leur utilisation sûre et efficace dans des applications cliniques en tant que dispositifs de diagnostic in vitro. Le consortium MAQC a réalisé trois projets entre 2005 et 2014 (à savoir MAQC I, II et III), donnant lieu à environ 30 publications, dont un tiers dans Nature Biotechnology. De plus, deux de ces articles figuraient parmi les plus cités dans Nature Biotechnology au cours des 20 dernières années.
Plus d'informations sont ici
La liste des publications issues du projet MAQC est ici
Ce qui est disponible dans la bibliothèque de référence technique
Ce qui est bien
- Ce sont des exemples de données étendues qui seront utiles pour montrer la capacité accrue de JMP à analyser les problèmes liés aux données étendues.
- Les données sont réelles et produisent des découvertes significatives.Par exemple, en utilisant les données sur le cancer du sein, effectuez une PCA, enregistrez les 10 principaux composants et utilisez-les avec GenReg pour prédire l'état des récepteurs d'œstrogènes.J'obtiens une valeur R carré de 75 %.
- Le projet a été très productif, générant plus de 30 publications (voir lien ci-dessus).T Deux de ces articles figuraient parmi les plus cités dans Nature Biotechnology au cours des 20 dernières années.Les contributeurs incluent notre propre Russ Wolfinger (et Kelci Miclaus).
- L'étude comportait 4 phases et les données chargées dans la bibliothèque proviennent de la phase 2, MAQC-II.La phase 2 utilisait des micro-réseaux et ils présentent des similitudes avec les puces semi-conductrices.Bien que les résultats (recherche sur le cancer) soient biologiques, la technique trouvera un écho auprès des spécialistes des semi-conducteurs, qui rencontrent également de nombreux problèmes de données.
