Über MAQC
Microarrays und Sequenzierung der nächsten Generation stellen Kerntechnologien in der Pharmakogenomik und Toxikogenomik dar; Bevor diese Technologien jedoch erfolgreich und zuverlässig in der klinischen Praxis und bei regulatorischen Entscheidungen eingesetzt werden können, müssen Standards und Qualitätsmaßnahmen entwickelt werden. Das MAQC-Projekt trägt dazu bei, die Microarray- und Sequenzierungstechnologien der nächsten Generation zu verbessern und ihre richtigen Anwendungen bei der Entdeckung, Entwicklung und Überprüfung von FDA-regulierten Produkten zu fördern. Jeder ist eingeladen, am MAQC-Projekt teilzunehmen.
Dabei handelt es sich um die von der FDA geleitete, gemeinschaftsweite Konsortialarbeit, die sich mit Fragen im Zusammenhang mit der Anwendung sich ständig weiterentwickelnder Hochdurchsatz-Genomtechnologien befasst, um entweder die Sicherheit und Wirksamkeit von FDA-regulierten Produkten oder deren sicheren und wirksamen Einsatz in klinischen Anwendungen als In-vitro-Diagnosegeräte zu bewerten. Das MAQC-Konsortium schloss zwischen 2005 und 2014 drei Projekte ab (nämlich MAQC I, II und III), was zu etwa 30 Veröffentlichungen führte, von denen ein Drittel in Nature Biotechnology veröffentlicht wurde. Darüber hinaus gehörten zwei dieser Arbeiten zu den am häufigsten zitierten in Nature Biotechnology in den letzten 20 Jahren.
Weitere Informationen finden Sie hier
Eine Liste der aus dem MAQC-Projekt resultierenden Veröffentlichungen finden Sie hier
Was ist in der technischen Referenzbibliothek verfügbar?
Was ist daran gut?
- Dies sind Beispiele für große Datenmengen und werden nützlich sein, um die erhöhte Fähigkeit von JMP bei der Analyse von großen Datenproblemen zu verdeutlichen
- Die Daten sind real und liefern aussagekräftige Erkenntnisse.Führen Sie beispielsweise anhand der Brustkrebsdaten eine PCA durch, speichern Sie die zehn wichtigsten Hauptkomponenten und verwenden Sie sie mit GenReg, um den Östrogenrezeptorstatus vorherzusagen.Ich erhalte einen R-Quadrat-Wert von 75 %.
- Das Projekt war sehr produktiv und brachte über 30 Veröffentlichungen hervor (siehe Link oben).T Zwei dieser Arbeiten gehörten zu den am häufigsten zitierten in Nature Biotechnology in den letzten 20 Jahren.Zu den Mitwirkenden zählen unser eigener Russ Wolfinger (und Kelci Miclaus).
- Die Studie hatte 4 Phasen und die in die Bibliothek geladenen Daten stammen aus Phase 2, MAQC-II.In Phase 2 wurden Mikroarrays verwendet, die Ähnlichkeiten mit Halbleiterchips aufweisen.Obwohl die Ergebnisse (Krebsforschung) biologischer Natur sind, wird die Technik bei Leuten aus der Halbleiterbranche Anklang finden, wo es ebenfalls große Datenprobleme gibt.