Tengo un cliente que cambió de JMP Genomics a JMP Pro y busca replicar un flujo de trabajo de análisis.
Aquí está la descripción de su análisis deseado:
Estoy tratando de determinar la proporción de alelos paternos en un conjunto de progenie y/o obtener una estimación de la introgresión de la genética masculina en las progenies. El diseño consistió en un cruce pareado (biparental) y otro procedente de polinización abierta (una hembra y varios machos). Recuerdo que esto se puede hacer en JMPGenomics pero no recuerdo los pasos. El conjunto de datos del genotipo tiene el sistema de puntuación SNP 0,1,2 (siendo el 2 el heterocigoto).
¿Es posible este flujo de trabajo en JMP Pro? De ser así, me gustaría brindar orientación general sobre los pasos y plataformas que usaríamos para replicar el análisis.
¡Cualquier orientación de los expertos de JMP Genomics sería muy apreciada!
Gracias de antemano,
