Ho un cliente che è passato da JMP Genomics a JMP Pro e sta cercando di replicare un flusso di lavoro di analisi.
Ecco la descrizione dell'analisi desiderata:
Sto cercando di determinare la proporzione degli alleli paterni in un insieme di progenie e/o di ottenere una stima dell'introgressione della genetica maschile nelle progenie. Il disegno consisteva in un incrocio accoppiato (biparentale) e l'altro da impollinazione aperta (una femmina e più maschi). Ricordo che questo può essere fatto in JMPGenomics ma non riesco a ricordare i passaggi. Il set di dati del genotipo ha il sistema di punteggio SNP 0,1,2 (il 2 è l'eterozigote).
Questo flusso di lavoro è possibile in JMP Pro? In tal caso, vorrei fornire alcune indicazioni generali sui passaggi e sulle piattaforme che utilizzeremmo per replicare l'analisi.
Qualsiasi consiglio da parte degli esperti di JMP Genomics sarebbe molto apprezzato!
Grazie in anticipo,
