Ich habe einen Kunden, der von JMP Genomics zu JMP Pro gewechselt ist und einen Analyse-Workflow nachbilden möchte.
Hier ist die Beschreibung seiner gewünschten Analyse:
Ich versuche, den Anteil der väterlichen Allele in einem Nachkommensatz zu bestimmen und/oder eine Schätzung der Introgression der männlichen Genetik in die Nachkommen zu erhalten. Der Entwurf bestand aus einer gepaarten Kreuzung (biparental) und dem anderen aus offener Bestäubung (ein Weibchen und mehrere Männchen). Ich erinnere mich, dass dies in JMPGenomics möglich ist, kann mich aber nicht an die Schritte erinnern. Der Genotyp-Datensatz hat das SNP-Bewertungssystem 0,1,2 (die 2 ist die Heterozygote).
Ist dieser Workflow in JMP Pro möglich? Wenn ja, möchte ich einige allgemeine Hinweise zu den Schritten und Plattformen geben, die wir zur Replikation der Analyse verwenden würden.
Für jede Beratung durch die Experten von JMP Genomics wären wir sehr dankbar!
Dank im Voraus,
