J'ai un client qui est passé de JMP Genomics à JMP Pro et qui cherche à reproduire un flux de travail d'analyse.
Voici la description de son analyse souhaitée :
J'essaie de déterminer la proportion d'allèles paternels dans une descendance et/ou d'obtenir une estimation de l'introgression de la génétique mâle dans la descendance. Le modèle consistait en un croisement apparié (biparental) et un autre issu d'une pollinisation libre (une femelle et plusieurs mâles). Je me souviens que cela peut être fait dans JMPGenomics mais je ne me souviens pas des étapes. L'ensemble de données génotypiques a le système de notation SNP 0,1,2 (le 2 étant l'hétérozygote).
Ce flux de travail est-il possible dans JMP Pro ? Si tel est le cas, j'aimerais fournir des conseils généraux sur les étapes et les plates-formes que nous utiliserions pour reproduire l'analyse.
Tout conseil des experts de JMP Genomics serait très apprécié !
Merci d'avance,
