効果サイズ計算アドインこのアドインは、通常の最小二乗レポート (Fit Model によって生成される) から推定値を取り込み、モデルの効果推定値、F 比、p 値、および効果の大きさの 3 つの測定値のテーブルを数式列として保存します (イータ二乗、部分イータ二乗、オメガ二乗) 。 ペアごとの分析が存在し、「順序付き差異」レポートが利用可能な場合、ペアごとの効果サイズを含む推定値の結合データ テーブル (コーエンのD ) は、コーエンの d の信頼区間 (v.0.06 時点) を含めて生成されます。ペアごとの分析が存在しない場合、このアドインは、選択したレポートにペアごとの分析を追加するよう求めるプロンプトを発行します。 v0.07 以降、誤検出率は p 値を調整しました (ベンジャミニ・ホッホベルグ調整)テーブルにも書き込まれます。
説明書(アドインのインストール後):
- [分析] > [モデルの適合] を使用して、通常の最小二乗モデルを適合します。
- [アドイン] > [効果量の計算] > [最小二乗レポートから (モデルの適合)] に移動します。
- 複数のフィットモデル最小二乗レポートが開いている場合は、使用する分析を選択するダイアログが表示されます。
カテゴリカル因子を持つモデルの場合:
- ペアごとの分析 (スチューデントの t 検定など) と「順序付き差分」レポートが利用可能な場合、利用可能なペアごとの効果の信頼区間を含むコーエンの d が計算され、結合されたデータ テーブルに保存されます。
- ペアごとの分析が作成されていない場合 (または「順序付き差異」レポートが作成されていない場合)、これらの分析を追加して効果量を計算するためのプロンプトが表示されます。
出力：
統計メモ:
- このアドインは、通常の最小二乗モデルの推定効果量、信頼区間、FDR 調整済み p 値を提供します (変量効果のあるモデルはサポートされていません)。
- 生成される効果サイズ:
モデルの効果サイズ:
エタ二乗
部分イータ二乗
オメガスクエアード
- オメガ 2 乗の負の値も可能であり、自動的に 0 に設定されます。
ペアごとの効果量:
コーエンのD
注: 多因子モデルおよび 3 レベル以上の 1 因子モデルでは、モデルのプールされたセル内誤差項 (RMSE) が、ペアごとの効果サイズを計算するための SDpooled として使用されます。 このような場合、結果として得られる効果量を次のように呼ぶのが一般的です。二乗平均平方根の標準化効果(RMSSE)。分散の均一性の仮定に違反していない場合、RMSE は母集団シグマの統計的に最も効率的な (分散が最小の) 推定量であるため、これは適切 (かつ望ましい) です。
更新履歴
- v0.03 - ペアごとの差に関するコーエンの d 計算と、ペアごとの分析が存在しない場合に生成するダイアログを追加しました。
- v0.04 - カテゴリカル因子のないモデルのペア比較を追加するプロンプトを抑制するコードを追加しました
- v0.05 - Windows で実行する際の不具合を修正しました (最小二乗法レポートが検出されませんでした)。 利用可能な最小二乗レポートから選択するためのサポート ダイアログを追加しました。
- v0.06 - コーエンの D に関する信頼区間のサポートを追加
- v.0.07 - False Discovery Rate p-Value のサポートを追加しました
ライフサイエンス統計公共事業Re: エフェクト サイズ計算アドインこんにちは！ また、エフェクト サイズの出力ウィンドウもありません。 何かご意見は？@ジュリアン
Re: エフェクト サイズ計算アドインこんにちは、ジュリアン。私のデータには、同じラット間での繰り返しの測定も含まれています。 したがって、2016 年以降の他のユーザーと同様に、私も多くの変数の効果量 (コーエンの d) を取得する必要があります。 同じラットで 5 回測定されたものもあれば、2 回だけ測定されたもの、1 回だけ測定されたものもあります。 フィットモデルをグループごとに実行し、時間をかけて実行できますが、これは繰り返しの測定に対応していますか?
Re: エフェクト サイズ計算アドインこのプラグインを反復測定モデルで動作させる方法はありますか。たとえば、反復測定アドインを使用しますか?
Re: エフェクト サイズ計算アドインこんにちは、ジュリアン - 私も上記と同じ問題で実行しています - つまり、次のことが可能であれば素晴らしいと思います効果量を計算し、仮定を確認します。また、改善をサポートする繰り返しの測定や混合モデルも歓迎します。 現在、これを行うには他のソフトウェア (JASP/Jamovi) に切り替える必要があり、少し時間がかかります。 それが解決できれば良いですね！ 乾杯、エルンスト
Re: エフェクト サイズ計算アドインジュリアン、この問題は解決されましたか? 以前にアドインを使用したことがありますが、出力が空白になりました
ダグ
Re: エフェクト サイズ計算アドインこんにちは、ジュリアンさん
OliviaWen と同じ問題が発生し、エフェクト サイズが出力されません。
ありがとう、
1月
Re: エフェクト サイズ計算アドインこんにちは@OliviaWen 、
何が起こっているのかを把握できるよう、今すぐダイレクト メッセージでご連絡いたします。
@ジュリアン
Re: エフェクト サイズ計算アドインこんにちは、ジュリアンさん
モデルのフィットで効果の大きさを計算する手順に従いました。 ただし、モデル効果サイズの出力ウィンドウが表示されません。 ウィンドウがどこにあるのか、あるいは何を間違えたのか推測できますか? ありがとう！
Re: エフェクト サイズ計算アドインこんにちは@TCM 、
うーん、添付ファイルは表示されません。コメントには添付ファイルを含めることはできないと思います。 お気軽に Julian.Parris@jmp.com に直接メールしてください。そこで会話を続けることができます。得られた洞察があればこのスレッドを更新します。
Re: エフェクト サイズ計算アドインこんにちは、ジュリアンさん
ここにあります。 そして、私は製品間の違いを検出するための最良の方法を積極的に使用します。 ところで、他にも多くの応答がありますが、私たちが知っている限り、それらの中で重要な順序はありません。
Re: エフェクト サイズ計算アドイン素晴らしい！
申し訳ありませんが、添付ファイルを挿入ボタンが見つかりません。挿入/編集リンクのみが表示されます。
Re: エフェクト サイズ計算アドインはい、d の推定値が異なる理由の診断に役立つデータ表を添付していただければ可能です。それは良い第一歩です。2 番目の考慮事項は、これがこれらのデータの分析に最適な方法であるかどうかです。 あなたが得たものは、方法論的には反復測定実験に近いように思えます。その場合、これらのデータを少し異なる方法で分析することをお勧めします。 データテーブルを見ることは、それを評価するのに確かに役立ちます。
Re: エフェクト サイズ計算アドインジュリアン、
迅速な対応ありがとうございました。私は統計学者ではありません (私はコンピューター サイエンスに分類されるデータ サイエンティストですが、人々は同じだと思っています 
) なので、いくつかの知識のギャップがあることをお詫びします。
グループという用語を同じように使用しているかどうかはわかりません。私が持っているのは7人です。これらの人々は室温で製品を評価しました。別の日には、同じ 7 人が同じ製品を評価しましたが、その製品は老化が促進されました。目的は、室温の製品と古い製品との間で、製品の特徴 (これらの人々によって評価された製品が多数あります) に知覚可能な違いがあるかどうかを確認することでした。
応答と積としての特徴を使用して、y by x の一方向フィットを実行しました (RT と熟成の 2 つのレベルがあります)。モデルの適合スキームでは、一方向と同じ変数を使用してモデルを適合しました。コーエンの d を手動で計算する必要がないため (「サブリミナル メッセージ」チュートリアルからの計算)、フィット モデルのアイデアが気に入っています。注意: 正常かどうかはチェックしませんでした。私はただそう思っただけです。 両方の分析で同じことを仮定しているので、できると思いました。 役立つ場合は、短いデータセットをお送りします (14 行と 1 つの応答のみ)。
Re: エフェクト サイズ計算アドインこんにちは@TCM 、
ここで何が起こっているのか推測できると思います。 テーブルに 3 つ以上のグループがありますが、それらのうちの 2 つだけの差について d を計算していますか? その場合、このルートを選択したことはまったく間違っていませんでした。計算した d の値に小さな違いが見られたのは、母集団標準偏差の推定値がどこから来たのかによるものです。 モデルの適合ルートを選択すると、d の推定値は、すべてのグループにわたってプールされた標準誤差に基づきます。 これについてはアドインの説明に注記がありますが、もう少し目立つようにする必要があります。 「」と書かれています。注: 多因子モデルと 3 レベル以上の 1 因子モデルでは、モデルのプールされたセル内誤差項 (RMSE) が、ペアごとの効果サイズを計算するための SDpooled として使用されます。 このような場合、結果として得られる効果量を次のように呼ぶのが一般的です。二乗平均平方根の標準化効果(RMSSE)。分散の均一性の仮定に違反していない場合、RMSE は母集団シグマの統計的に最も効率的な (分散が最小の) 推定量であるため、これは適切 (かつ望ましい) です。」
したがって、複数のグループがある場合、それらのグループのうちの 2 つだけから手動で d を計算した場合の推定値と、このアドインによる計算では若干異なります。 これで違いが説明できますか? そうでない場合は、これを詳しく調べて、何が起こっているのかを理解しましょう。
Re: エフェクト サイズ計算アドインジュリアン、
最初の投稿がなぜうまくいかなかったのか分かりません...
あなたが言及したように、フィットモデルルートを使用して d を計算しましたが、グループ平均の値と標準偏差のプールされた推定値から手動で計算しました（OneWayから-2グループの平均を比較）。適合モデルの d 値は、手動計算よりもわずかに低くなりました。私の本来の目的は、2 つのグループ平均間の差を示すことです (検出可能な差がないことを確認するために、安定性プロトコルの前後で 7 人に製品を評価してもらいました)。ショートカット (アドインを使用してモデルのルートを適合させる) を選択したのは間違いでしたか?
Re: エフェクト サイズ計算アドインはい！
Re: エフェクト サイズ計算アドインこれはより複雑ですが、おそらくコーエンの f^2 の形で、ランダム効果を持つモデルのサポートを追加することを検討しました。 それはあなたが念頭に置いていた効果量ですか？
Re: エフェクト サイズ計算アドイン素晴らしいツールです。 残念ながらランダム効果はサポートされていません。 将来的には可能でしょうか？
Re: エフェクト サイズ計算アドインこんにちは@benson_munyan 、
Windows または Mac の JMP 14 または JMP 13 ではこの問題を再現できません。 セットアップに関する追加の詳細と、データ テーブルに特有の可能性がある点について教えていただけますか? この真相に迫ります。
@ジュリアン
Re: エフェクト サイズ計算アドイン@wsmitty 、 @ジュリアン, 私も同じ現象を経験しています。 何かアドオンが壊れたのでしょうか、それともLSMモデルの設定が間違っているのでしょうか?Re: エフェクト サイズ計算アドインこんにちは、
以前のバージョンでこれを使用していましたが、07に更新したところ、ES計算ができなくなりました（写真を参照）。 また、集計データテーブルも照合されません。 以前にアドインを使用したのと同じ手順を使用しました (ちなみに、これは素晴らしいと思いました)。 しかし、この試みには愛はありません
私が何か間違ったことをしているのではないかと思っていますか？ アドインをアンインストールして再インストールしました...愛はありません。
ご協力をいただければ幸いです。
乾杯
ES OutputES OutputES OutputES OutputES OutputES OutputES OutputES OutputES OutputES OutputES OutputES OutputES OutputES OutputES OutputES OutputES OutputES OutputES OutputES OutputES OutputES OutputES OutputES OutputES出力
Summary tableSummary tableSummary tableSummary tableSummary tableSummary tableSummary tableSummary tableSummary tableSummary tableSummary tableSummary tableSummary tableSummary tableSummary tableSummary tableSummary tableSummary tableSummary tableSummary tableSummary tableSummary tableSummary tableSummary table概要表
Re: エフェクト サイズ計算アドインやあ、
JMP での反復測定または混合モデルの効果サイズの計算に関する更新があるかどうか疑問に思っていましたが、それは非常に便利です。 (それらを計算するために SPSS に戻らなければならないのは残念です...)
Re: エフェクト サイズ計算アドイン<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" />ありがとう、ジュリアン、それは本当に便利です! JMP がこれらの変更の一部を自ら組み込んで取り組んでくれることを願っています。全体的にインターフェースの使いやすさと対話性は非常に優れていますが、不十分な点がいくつかあります (例: 効果量の計算、仮定のチェックとそれらのレポートなど) 、混合モデル (ただし、アドインはその問題のほとんどを適切かつエレガントに修正します)。 すべての分析に JMP を使用したいと思っていますが、いくつかの目的で SPSS または別のソフトウェアに戻ることに気づきました。近い将来、JMP を使用する必要がなくなることを願っています。
Re: エフェクト サイズ計算アドインこのアドインが便利だと思っていただけてとてもうれしいです!混合モデルの効果サイズの計算は少し複雑ですが、ぜひ取り入れたいものです。 できる限り早くここに最新情報を投稿します。
Re: エフェクト サイズ計算アドインこのアドインをありがとう。これは非常に便利です。 実際に使用されている式を確認できることは、実に大きな利点です。
反復測定や混合モデルでも機能する効果量アドインを作成する計画はありますか? これは、特に統計専門家ではない人に教えるために JMP を使用する場合に非常に有益です。私はちょうど貴社の反復測定アドインを発見しました。反復測定や混合計画に対してより簡単に効果サイズを生成する方法があれば、大きなプラスになるでしょう。
Re: エフェクト サイズ計算アドインこれは素晴らしい！ これらを手動で計算するのは十分簡単ですが、自動的に計算させるとさらに簡単です。 Eta^2、Partial Eta^2、Omega^2 が含まれていることも気に入っています。
これらに慣れていない人のために、列を右クリックして [数式] を選択すると、計算方法を確認することもできます。
Re: エフェクト サイズ計算アドイン終わり！ 新しいバージョンでは、アクティブなウィンドウを使用するのではなく、開いているウィンドウで最小二乗レポートを検索します。 使用可能なレポートが 1 つだけの場合はそのレポートが使用されます。それ以外の場合は、どの最小二乗レポートを使用するかを選択するダイアログが表示されます。
Re: エフェクト サイズ計算アドインWindows と Mac ではウィンドウの名前にいくつかの違いがあるようです。現在、この問題の修正に取り組んでいます。
Re: エフェクト サイズ計算アドイン
このエラーメッセージが表示され続けます。 何を選択すればよいでしょうか? 最小二乗法フィット出力の出力は、アクティブなウィンドウ (PC 上) です。
Re: エフェクト サイズ計算アドインこんにちは@スーチャーン、
Fit Model で設定しているどのようなモデルが失敗しているのか、もう少し詳しく教えていただけますか? 現時点では、標準最小二乗特性を使用する (ランダム効果を使用しない) モデルのみがアドインで動作します。 実行しているモデルがそのような種類の場合は、以下のコードを実行して単純な二元配置分散分析を生成し、アドインを実行してそれでも失敗するかどうかを確認してみてはいかがでしょうか。 それは物事を追跡するのに役立ちます。
@ジュリアン
//Open Data Table: Big Class.jmp
Open( "$SAMPLE_DATA/Big Class.jmp" );
//Report snapshot: Big Class - Fit Least Squares
Data Table( "Big Class" ) << Fit Model(
Y( :weight ),
Effects( :age, :sex, :age * :sex ),
Personality( "Standard Least Squares" ),
Emphasis( "Minimal Report" ),
Run(
:weight << {Summary of Fit( 1 ), Analysis of Variance( 1 ),
Parameter Estimates( 1 ), Lack of Fit( 0 ), Scaled Estimates( 0 ),
Plot Actual by Predicted( 0 ), Plot Regression( 0 ),
Plot Residual by Predicted( 0 ), Plot Studentized Residuals( 0 ),
Plot Effect Leverage( 0 ), Plot Residual by Normal Quantiles( 0 ),
Box Cox Y Transformation( 0 )}
)
);Re: エフェクト サイズ計算アドイン@ジュリアン、ご返信いただきありがとうございます！ 私は統計にあまり詳しくないので、ご質問にお答えできれば幸いです。 別の「繰り返し測定」アドインを介して繰り返し測定を行う完全要因計画 (混合モデル) を実行しています。 モデルダイアログにはランダムな効果があることが示されているため、おそらくそれが問題です。
このタイプのモデルの効果量の部分イータ二乗値を取得する別の方法はありますか?
Re: エフェクト サイズ計算アドイン@スーチャーン, ああ、そうです、私の完全階乗反復測定アドインを使用している場合、この効果量計算機と互換性のないモデルが生成されます。 特にこれらのランダム効果の導入を開始すると可能なモデルの多様性を考慮すると、これを行う標準的な方法についての合意があまりないため、私はそのサポートを追加しませんでした。 私が言える最善のことは、その方法についての参考文献を自分の分野で見つけて、その方法を反映することです。
Re: エフェクト サイズ計算アドイン私はアドインを使用していますが、学生の t では正常に動作しています。私
ANOM を使用して効果量を計算したいですか?解決策はありますか?
Re: エフェクト サイズ計算アドインこんにちは@Gayl 。 ANOM には特定の実装はありませんが、効果の大きさ d が、元のデータの変動性と比較して観察されたグループ間の差異の関数であることは注目に値します。これは仮説検定ではありません。どの仮説検定を選択しても効果量は決まりません。つまり、最終的に t 検定や ANOM などで差を検定しても、結果は同じになります。
