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Importación de datos espectrales SPA (absorción de fotón único) en JMP

Hola,

'¿Alguien ha oído hablar de los datos espectrales SPA? Tengo un cliente que tiene ese tipo de datos y no parece sencillo importarlos en JMP (es necesario pasar por Matlab y Python). ¿Alguien sabe cómo podemos importar esos datos de forma más sencilla en JMP?

Gracias de antemano,

Salud,

valerie

Re: Importación de datos espectrales SPA (absorción de fotón único) en JMP

El formato de archivo SPA parece ser binario. Probablemente podría ser hecho con algunas funciones JSL Blob, probablemente sería más fácil y directo usar un paquete Python para hacer esto. Una búsqueda rápida en Google muestra que hay al menos 4 paquetes de Python que pueden leer estos datos en un datagrama, que luego podría escribirse en CSV e importarse a JMP.  

Re: Importación de datos espectrales SPA (absorción de fotón único) en JMP

¡Gracias Sam!

Re: Importación de datos espectrales SPA (absorción de fotón único) en JMP

To handle SPA (Spectral Analysis) files in JMP, convert the proprietary SPA format, which stores spectral data along with metadata and calibration information, to a more accessible format like CSV using Python. The SPA format includes headers with instrument settings, measurement parameters, date and time, sample information, and the actual spectral data such as wavelength and intensity/absorbance values. First, install the numpy and scipy libraries. Then, use a Python script to load the SPA file and extract the spectral data, saving it as a CSV file and bring it to JMP.

import numpy as np
import scipy.io

spa_data = scipy.io.loadmat('path_to_your_spa_file.spa')
spectral_data = spa_data['data']  # Adjust this key as per your SPA file structure
np.savetxt('converted_data.csv', spectral_data, delimiter=',')

Re: Importación de datos espectrales SPA (absorción de fotón único) en JMP

Estaba trabajando en algo en este sentido cuando vi esta publicación, así que probé scipy.io (como sugirió @Chandramouli_R ) para acceder a los archivos .spa que encontré en Github , pero no tuve suerte ni identifiqué ninguna ayuda adicional. de los documentos de scipy.io . Probablemente sea solo mi ignorancia. Sin embargo, utilicé una de las ofertas en Github para leer archivos .spa e incluí los esfuerzos como parte de un diario de integración de Python que se encuentra en el TRL aquí . Sin embargo, parece que los archivos .spa pueden diferir en estructura (como señala ZGainsforth en los comentarios después del código aquí ), por lo que "un código para todos" puede ser poco probable, en lugar de requerir que SME y un editor binario/hexadecimal evalúen las diferencias y realicen modificaciones. al código de importación de Python.