RNAseq 數據標準化JMP Genomics 有一些針對 RNAseq 資料的標準化方法，包括 KDMM、RPM 縮放、TMM、TPM 和上四分位數縮放。 JMP Pro 17 缺少如此重要的工具。
RNAseq 或其他大規模數據（例如代謝組學）標準化方法的目的是減少系統實驗偏差和技術變異。 由於數據未標準化，稿件可能會被期刊拒絕。 RNAseq 最常用的標準化方法是「每百萬映射讀取中每千鹼基轉錄本的讀取」(RPKM)（莫爾塔扎維等人， 2008年； doi：10.1038/nmeth.1226 ) 和 M 值的截尾平均值 (TMM) (羅賓遜和奧什拉克； doi：10.1186/gb-2010-11-3-r25）。
我的願望是將標準化方法納入 JMP Pro
基礎資料分析與建模回覆：RNAseq 數據標準化 - 狀態更改為：正在調查@Marina_N謝謝你的回饋。我們正在考慮將來為基因組數據添加一些額外的標準化工具。
