您好，我正在从在 JMP Genomics 中运行微阵列数据过渡到 JMP Pro。
我通常使用预定义的 JMP Genomics 脚本，例如：
分析过程/工作流程/基本/基本表达式工作流程或
分析过程/表达/标准化/数据标准化程序。
我能够重现标准化脚本的 STD 标准化步骤，但不能重现基本表达式工作流程。
原因之一是很难识别分析中使用的所有步骤，以便计算创建火山图（“查看数据”输出中附加的数据表示例）、聚类和热图以及 PCA 图（附截图）。 另一个原因是我在“分析/筛选/响应筛选”或“分析/拟合模型/个性：响应筛选”下找到了使用 JMP Pro 的“响应筛选”选项的说明，但没有一个提供所有可用选项。 第一个给出火山图，但不允许复杂模型，第二个允许复杂模型（但不允许随机变量），但不给出火山图。 它们都显示 LogWorth 的 p 值截止值为 0.01 和 0.05，但仅针对 p=0.01 绘制图表。 有没有办法将其更改为 0.05 或定义另一个 p 值？ 有没有办法重现 JMP Pro 中“基本表达式工作流程”中包含的相同批次分析？
