안녕하세요. 저는 JMP Genomics의 마이크로어레이 데이터 실행에서 JMP Pro로 전환 중입니다.
저는 다음과 같이 미리 정의된 JMP Genomics 스크립트를 일상적으로 사용합니다.
분석 프로세스/작업 흐름/기본/기본 발현 작업 흐름 또는
분석 프로세스/표현/정규화/데이터 표준화 절차.
정규화 스크립트의 STD 정규화 단계를 재현할 수 있었지만 기본 표현식 워크플로는 재현할 수 없었습니다.
한 가지 이유는 화산 플롯("데이터 보기" 출력에서 첨부된 데이터 테이블의 예), 클러스터 및 열 지도 및 PCA 플롯( 스크린샷 첨부). 또 다른 이유는 "분석/선별/응답 선별" 또는 "분석/맞춤 모델/성격: 응답 선별"에서 JMP Pro의 "응답 선별" 옵션을 사용하는 지침을 찾았지만 그 중 어느 것도 모든 옵션을 사용할 수 없기 때문입니다. 첫 번째는 화산 플롯을 제공하지만 복잡한 모델을 허용하지 않으며 두 번째는 복잡한 모델(확률 변수는 아님)을 허용하지만 화산 플롯을 제공하지 않습니다. 둘 다 LogWorth에 대해 p-값 컷오프가 0.01과 0.05로 표시되지만 그래프는 p=0.01에 대해서만 작성됩니다. 0.05로 변경하거나 다른 p-값을 정의할 수 있는 방법이 있나요? JMP Pro의 "기본 표현식 작업 흐름"에 포함된 동일한 배치 분석을 재현할 수 있는 방법이 있습니까?
