是什麼激發了這個願望清單請求? 請描述目前需要改進的問題,或目前不容易或不可能解決的新問題。
允許其他 RNA-seq 標準化方法,例如 TMM、RPKM、TPM、KDMM、比率中位數
請描述您希望看到的新的或改進的功能或解決方案。
如果提供此新功能,對您和/或其他使用者有什麼價值? 任何有關易用性、節省時間、新功能價值的資訊將不勝感激。 如果您可以透過其他軟體解決方案獲得此功能,請描述該軟體工具。
提供用於 RNA-seq 數據的常見轉換/標準化方法,以幫助分析該數據。
從“列”功能表或右鍵單擊“新列公式”,提供包含這些的轉換選項。 輸出不應在列中包含列公式(這些方法適用於 100 個樣本/行中的 10,000 個列)
這是外部客戶的請求嗎? 如果是,請提供客戶帳戶名稱、主要聯絡人以及提出要求的使用者。
是的,USDA-ARS,但在使用此類數據的其他人中也很常見。曾在 JMP Genomics 工作。 還有康乃爾大學和嘉吉大學
是否有具有我們應該注意的此功能或解決方案的競爭軟體包? 請提供有關競爭性軟體的任何信息,包括網站連結、演示或範例。
R/Bioconductor 其他基因表現分析工具(GeneSpring、Omic Soft 等)
這是否會影響客戶的續約、擴展或採用?如果我們不解決這個問題,是否會導致帳戶面臨風險? 請提供帳戶具體問題的合理詳細資訊和描述。
不確定,但它可能會阻止小型組織的新銷售,這些組織沒有可以為客戶產生這些數據的生物資訊部門。
@克里斯_基希伯格- 謝謝你的建議! 我們已收到您的請求並將予以考慮。