您好，我正在從在 JMP Genomics 中運行微陣列資料過渡到 JMP Pro。
我通常使用預先定義的 JMP Genomics 腳本，例如：
分析流程/工作流程/基本/基本表達式工作流程或
分析過程/表達/標準化/資料標準化程序。
我能夠重現標準化腳本的 STD 標準化步驟，但不能重現基本表達式工作流程。
原因之一是很難識別分析中使用的所有步驟，以便計算創建火山圖（「查看資料」輸出中附加的資料表示例）、聚類和熱圖以及 PCA 圖（附截圖）。 另一個原因是我在「分析/篩選/回應篩選」或「分析/擬合模型/個性：回應篩選」下找到了使用 JMP Pro 的「回應篩選」選項的說明，但沒有一個提供所有可用選項。 第一個給出火山圖，但不允許複雜模型，第二個允許複雜模型（但不允許隨機變數），但不給出火山圖。 它們都顯示 LogWorth 的 p 值截止值為 0.01 和 0.05，但僅針對 p=0.01 繪製圖表。 有沒有辦法將其更改為 0.05 或定義另一個 p 值？ 有沒有辦法重現 JMP Pro 中「基本表達式工作流程」中包含的相同批次分析？
