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Comment supprimer des chiffres entre parenthèses dans des séquences de lettres

Comment puis-je trouver modifié séquences peptidiques (par exemple, SYELPDGQV(+.98)I(+10.98)T(-17.03)IGNER ) dans la table de saut lorsque recherche de la séquence non modifiée (SYELPDGQVITIGNER) ?

 

Si l'algorithme de recherche ne peut pas être modifié, est-il possible de générer une nouvelle colonne en supprimer tous les nombres entre parenthèses des séquences composées uniquement de lettres ?

 

par exemple, entrée de la colonne d'origine : NLTEE(+.98)LAGLDE(+28.99)T(+10.98)IAK

générer automatiquement une nouvelle colonne avec entrée : NLTEEMAGLDETIAK

Analyse et modélisation des données de baseMélange et nettoyage des donnéesExploration et visualisation des donnéesRe : Comment supprimer les chiffres entre parenthèses des séquences de lettres

Vous pouvez également utiliser Substitut

Names Default To Here(1);

str1 = "NLTEE(+.98)LAGLDE(+28.99)T(+10.98)IAK";
str2 = "SYELPDGQV(+.98)I(+10.98)T(-17.03)IGNER";

res1 = Substitute(str1, Items(Get Punctuation Characters(Include Chars("0123456789")), ""), "");
res2 = Substitute(str2, Items(Get Punctuation Characters(Include Chars("0123456789")), ""), "");

ou créez une regex à l'aide de l'explorateur de texte de JMP

Notez que cela les laissera sous forme de "mots" séparés comme c'est le cas pour Text Explorer, vous devrez donc supprimer les espaces, cela peut être fait avec Search par exemple.

 

Re : Comment supprimer les chiffres entre parenthèses des séquences de lettres

Vous pouvez créer une nouvelle colonne en utilisant Regex ou Substitute

 

Names Default To Here(1);

str1 = "NLTEE(+.98)LAGLDE(+28.99)T(+10.98)IAK";
str2 = "SYELPDGQV(+.98)I(+10.98)T(-17.03)IGNER";

Show(Regex(str1, "[^ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ]", "", GLOBALREPLACE));
Show(Regex(str2, "[^ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ]", "", GLOBALREPLACE));

Cela suppose que vous souhaitiez conserver uniquement les lettres. Vous pouvez le construire par exemple en utilisant Recode

 

et vous pouvez également utiliser des expressions régulières avec la recherche

 

Modifier:

Une meilleure regex ressemble probablement à ceci

Names Default To Here(1);

str1 = "NLTEE(+.98)LAGLDE(+28.99)T(+10.98)IAK";
str2 = "SYELPDGQV(+.98)I(+10.98)T(-17.03)IGNER";

res1 = Regex(str1, "\(.*?\)", "", GLOBALREPLACE);
res2 = Regex(str2, "\(.*?\)", "", GLOBALREPLACE);

show(res1, res2);

Re : Comment supprimer les chiffres entre parenthèses des séquences de lettres

Merci beaucoup pour vos réponses rapides et utiles