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So löschen Sie Zahlen in Klammern aus Buchstabenfolgen

Wie kann ich finde geändert Peptidsequenzen (z. B. SYELPDGQV(+.98)I(+10.98)T(-17.03)IGNER ) in der Sprungtabelle, wenn Durchsuchen der unveränderten Sequenz (SYELPDGQVITIGNER)?

Wenn der Suchalgorithmus nicht geändert werden kann, ist es möglich, eine neue Spalte zu generieren Löschen aller Zahlen in Klammern aus den Buchstabenfolgen ?

Beispiel: Eintrag Originalspalte: NLTEE(+.98)LAGLDE(+28.99)T(+10.98)IAK

Automatische Generierung einer neuen Spalte mit Eintrag: NLTEEMAGLDETIAK

Grundlegende Datenanalyse und Modellierung

Datenmischung und -bereinigung

Datenexploration und -visualisierung

Betreff: So löschen Sie Zahlen in Klammern aus Buchstabenfolgen

Sie können auch „Ersetzen“ verwenden

Names Default To Here(1);

str1 = "NLTEE(+.98)LAGLDE(+28.99)T(+10.98)IAK";
str2 = "SYELPDGQV(+.98)I(+10.98)T(-17.03)IGNER";

res1 = Substitute(str1, Items(Get Punctuation Characters(Include Chars("0123456789")), ""), "");
res2 = Substitute(str2, Items(Get Punctuation Characters(Include Chars("0123456789")), ""), "");

oder erstellen Sie einen regulären Ausdruck mit dem Text-Explorer von JMP

Beachten Sie, dass sie dadurch als separate „Wörter“ verbleiben, wie es für den Text-Explorer verwendet wird. Sie müssen also die Leerzeichen entfernen. Dies kann beispielsweise mit der Suche erfolgen

Betreff: So löschen Sie Zahlen in Klammern aus Buchstabenfolgen

Sie können eine neue Spalte mit Regex oder Substitute erstellen

Names Default To Here(1);

str1 = "NLTEE(+.98)LAGLDE(+28.99)T(+10.98)IAK";
str2 = "SYELPDGQV(+.98)I(+10.98)T(-17.03)IGNER";

Show(Regex(str1, "[^ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ]", "", GLOBALREPLACE));
Show(Regex(str2, "[^ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ]", "", GLOBALREPLACE));

Dies setzt voraus, dass Sie nur die Buchstaben behalten möchten. Sie können es beispielsweise mit Recode erstellen

Sie können bei der Suche auch reguläre Ausdrücke verwenden

Bearbeiten:

Ein besserer regulärer Ausdruck ist höchstwahrscheinlich so etwas

Names Default To Here(1);

str1 = "NLTEE(+.98)LAGLDE(+28.99)T(+10.98)IAK";
str2 = "SYELPDGQV(+.98)I(+10.98)T(-17.03)IGNER";

res1 = Regex(str1, "\(.*?\)", "", GLOBALREPLACE);
res2 = Regex(str2, "\(.*?\)", "", GLOBALREPLACE);

show(res1, res2);