호르몬과 대사산물의 상관 관계(Omics 데이터)모두들 안녕,
저는 회사의 오믹스 데이터를 통해 다양한 성장 단계에서 호르몬과 대사산물의 발현 사이의 상관관계를 찾으려고 노력하고 있습니다. 유형(호르몬 또는 대사산물), 이름(해당 화합물의), 단계(A,B,C 또는 D) 및 정규화된 단계 평균(표현 수준인 원시 데이터)의 4개 열로 데이터를 구성했습니다. 각 화합물의. 각 유형에 대해 정규화하고 단계별로 평균을 냈습니다.) 필요한 경우 데이터를 재구성할 수 있습니다.
저는 Y축에 호르몬이 있고 X축에 대사산물이 있는 그래프를 만들려고 했는데, 상관관계/히트맵이 있는 다변량 그래프처럼 보입니다. 저는 각 성장 단계에 대해 이러한 그래프 중 하나를 만들고 모든 단계의 전반적인 상관관계에 대해 동시에 하나를 만들고 싶습니다.
저는 그래프 빌더에서 이것을 만들고 분석 > 다변량을 사용해 보았습니다. 둘 다 효과가 없었습니다. 처음 세 열의 범주형 특성으로 인해 다변수에서는 허용되지 않습니다.
도와주세요. 어떻게 해야 하나요?
고급 통계 모델링기본 데이터 분석 및 모델링Re: 호르몬과 대사산물의 상관관계(Omics 데이터)안녕,
데이터 레이아웃에 대한 예시(모의 데이터가 가능함) 없이 정확한 피드백을 제공하는 것은 어렵습니다. 그럼에도 불구하고 가장 먼저 고려해야 할 것은 대사산물과 호르몬 데이터를 별도의 열로 분할하는 것입니다. 실제로 JMP에서는 별도의 열에 X 및 Y 데이터가 필요합니다.
둘째, 호르몬 데이터를 X로, 대사산물 데이터를 Y로, 단계를 WRAP 요인으로 사용하여 GraphBuilder 플롯을 구축할 수 있습니다.
그런 다음 상관관계 타원 + 점 도표 디스플레이를 사용하여 호르몬과 대사산물 간의 관계를 시각화할 수 있습니다. 마지막으로 플롯 영역 옆에 있는 왼쪽 대화형 메뉴에서 각 패널에 대한 r 제곱 및 상관 관계를 표시하도록 선택할 수 있습니다.
이것이 효과가 있는지 알려주세요.
설명이 형편없었다면 죄송합니다
최상의
TS
Re: 호르몬과 대사산물의 상관관계(Omics 데이터)안녕 @Kotton_King ,
데이터가 쌓여 있는 것 같습니다(단일 열의 값). 각 호르몬과 대사산물이 고유한 값 열을 갖도록 데이터를 분할할 수 있습니다. 그러면 다변량은 이러한 새 열과 함께 작동합니다. 또한 클러스터 변수를 살펴보십시오. 상관 관계에 대한 히트맵을 제공하고 클러스터링합니다.
건배,
