ホルモンと代謝物の相関関係 (オミクスデータ)こんにちは皆さん、
私は、会社のオミクスデータから、成長のさまざまな段階におけるホルモンの発現と代謝産物の間の相関関係を見つけようとしています。 データを 4 つの列で構造化しました: タイプ (ホルモンまたは代謝物)、名前 (当該化合物の)、相 (A、B、C または D)、および正規化された相の平均 (これは発現レベルを示す生データです)各化合物の。 タイプごとに正規化し、フェーズごとに平均しました）。 必要に応じてデータを再構築できます。
Y軸にホルモン、X軸に代謝物をとり、相関関係/ヒートマップを備えた多変量グラフのようなグラフを作成しようと考えていました。 成長の各段階についてこれらのグラフを 1 つ作成し、次にすべての段階の全体的な相関関係を一度に 1 つ作成したいと考えています。
グラフビルダーでこれを作成し、「分析」>「多変量」を使用してみましたが、どちらも機能しませんでした。 最初の 3 つの列のカテゴリ的な性質のため、多変量解析は使用できません。
助けてください、どうすればいいですか？
高度な統計モデリング基本的なデータ分析とモデリングRe: ホルモンと代謝物の相関関係 (オミクスデータ)こんにちは、
データ レイアウトの例 (モック データで十分) がなければ、正確なフィードバックを提供するのは困難です。 それでも、最初に考慮すべきことは、代謝物とホルモンのデータを別々の列に分割することです。 実際、JMP では X と Y データを別々の列に入れる必要があります。
次に、ホルモン データを X、代謝物データを Y、位相を WRAP 係数として使用して、GraphBuilder プロットを構築できます。
その後、相関楕円 + ドット プロット表示を使用して、ホルモンと代謝物の関係を視覚化できます。 最後に、プロット領域の隣にある左側の対話型メニューで、各パネルの r 二乗と相関を表示するように選択できます。
これが機能するかどうかお知らせください。
この説明がつまらない場合は申し訳ありません
最高
TS
Re: ホルモンと代謝物の相関関係 (オミクスデータ)こんにちは@kotton_king 、
データが積み上げられている (値が 1 つの列にある) ようです。 各ホルモンと代謝物に独自の値の列が含まれるようにデータを分割してみることができます。 その後、多変量はこれらの新しい列で機能します。 クラスター変数についても調べてください。 相関関係のヒートマップとクラスター化が提供されます。
乾杯、
