将激素与代谢物相关联(组学数据)大家好,
我试图从我公司的组学数据中找到不同生长阶段激素和代谢物表达之间的相关性。 我用 4 列构建数据:类型(激素或代谢物)、名称(所述化合物)、相(A、B、C 或 D)和标准化相平均值(这是原始数据,即表达水平各化合物。 我已经对每种类型进行了标准化并按阶段进行了平均)。 如有必要,我可以重组数据。
我正在考虑制作一个图表,其中 Y 轴上有激素,X 轴上有代谢物,看起来像带有相关性/热图的多元图。 我想为每个增长阶段制作一张图表,然后可能同时为所有阶段的总体相关性制作一张图表。
我尝试在图形生成器中进行此操作并使用“分析”>“多元”,但两者都不起作用。 由于前三列的分类性质,多元不会让我这样做。
请帮助我,我该怎么办?
高级统计建模基础数据分析和建模回复:将激素与代谢物相关联(组学数据)你好,
如果没有数据布局的示例(模拟数据即可),给您提供精确的反馈是一项挑战。 不过,您应该考虑的第一件事是将代谢物和激素数据分成单独的列。 事实上,JMP 需要将 X 和 Y 数据放在不同的列中。
其次,您可以构建一个 GraphBuilder 绘图,其中激素数据为 X,代谢物数据为 Y,阶段为 WRAP 因子。
然后,您可以使用相关椭圆+点图显示来可视化激素和代谢物之间的关系。 最后,在绘图区域旁边的左侧交互菜单中,您可以选择显示每个面板的 r 方和相关性。
让我们知道这是否有效。
抱歉,如果这个解释是微不足道的
最好的
TS
回复:将激素与代谢物相关联(组学数据)你好@科顿_King ,
听起来您的数据已堆叠(单列中的值)。 您可以尝试拆分数据,以便每种激素和代谢物都有自己的值列。 然后 Multivariate 将使用这些新列。 另请参阅簇变量。 它将为您提供相关性的热图并对它们进行聚类。
干杯,